More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0587 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  100 
 
 
316 aa  633  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  72.31 
 
 
321 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.34 
 
 
322 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.86 
 
 
325 aa  352  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  53.92 
 
 
327 aa  349  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  56.86 
 
 
323 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  56.86 
 
 
347 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.97 
 
 
313 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  55.33 
 
 
313 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.47 
 
 
319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  56.42 
 
 
305 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  49.34 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  55.52 
 
 
310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  55.74 
 
 
305 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  56.23 
 
 
317 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  55.71 
 
 
314 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  51.15 
 
 
312 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.55 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.23 
 
 
324 aa  325  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.96 
 
 
306 aa  325  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.36 
 
 
318 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  51.5 
 
 
309 aa  322  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  49.66 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  49.66 
 
 
320 aa  319  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  50.83 
 
 
309 aa  319  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  50.33 
 
 
308 aa  318  7e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  50.83 
 
 
309 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  52.82 
 
 
302 aa  318  9e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  49.16 
 
 
302 aa  318  9e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50 
 
 
320 aa  317  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.32 
 
 
315 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.59 
 
 
341 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50 
 
 
320 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50 
 
 
320 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  50.83 
 
 
309 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.17 
 
 
320 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  54.64 
 
 
310 aa  316  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  50.5 
 
 
309 aa  316  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  50.5 
 
 
309 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  50 
 
 
320 aa  315  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  50.17 
 
 
309 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  50.5 
 
 
309 aa  315  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  50.5 
 
 
309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.95 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.21 
 
 
302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.6 
 
 
321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  54.97 
 
 
324 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  56.38 
 
 
326 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.1 
 
 
319 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  54.45 
 
 
350 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.4 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  51.46 
 
 
359 aa  309  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  52.32 
 
 
319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  52.55 
 
 
318 aa  308  9e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.49 
 
 
314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.71 
 
 
314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  54.27 
 
 
350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.31 
 
 
312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.55 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.55 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.4 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  49.66 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.23 
 
 
330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  53.38 
 
 
325 aa  301  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  50.17 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  49.2 
 
 
315 aa  301  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  54.15 
 
 
328 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.17 
 
 
356 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.25 
 
 
310 aa  300  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 
337 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  47.97 
 
 
309 aa  299  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  44.04 
 
 
326 aa  298  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.54 
 
 
325 aa  298  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.3 
 
 
316 aa  297  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  49.5 
 
 
309 aa  296  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  53.23 
 
 
342 aa  296  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  54.14 
 
 
342 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  48.29 
 
 
296 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  48.29 
 
 
296 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  54.58 
 
 
332 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.5 
 
 
328 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  55.91 
 
 
325 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  49.19 
 
 
315 aa  292  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  50.8 
 
 
340 aa  291  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0902  ATPase  53.08 
 
 
335 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  51.61 
 
 
327 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0387  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 
329 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.99 
 
 
319 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  52.49 
 
 
335 aa  289  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.71 
 
 
327 aa  289  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.83 
 
 
336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.18 
 
 
327 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  50.18 
 
 
310 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.07 
 
 
326 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  48.22 
 
 
315 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  50.99 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.34 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>