More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2538 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
314 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.13 
 
 
315 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.81 
 
 
319 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  54.58 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  51.29 
 
 
317 aa  348  8e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  52.87 
 
 
318 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  52.26 
 
 
347 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.61 
 
 
314 aa  345  6e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  52.41 
 
 
323 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  53.11 
 
 
310 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.61 
 
 
313 aa  335  7e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  50.99 
 
 
327 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.51 
 
 
306 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.38 
 
 
324 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  49.04 
 
 
328 aa  331  8e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.83 
 
 
325 aa  331  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.71 
 
 
341 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.99 
 
 
313 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.55 
 
 
337 aa  329  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  49.01 
 
 
359 aa  329  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  53.29 
 
 
318 aa  328  7e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  49.52 
 
 
320 aa  328  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  49.2 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  50.17 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  51.31 
 
 
309 aa  326  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  51 
 
 
310 aa  326  4.0000000000000003e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  50.98 
 
 
309 aa  325  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  50.65 
 
 
309 aa  325  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  51.31 
 
 
309 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  50.33 
 
 
309 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
354 aa  325  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  50.65 
 
 
309 aa  324  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.85 
 
 
320 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  50.65 
 
 
309 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  50.99 
 
 
314 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.51 
 
 
320 aa  322  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  51.15 
 
 
310 aa  322  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  50.33 
 
 
309 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  51.48 
 
 
310 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  50.33 
 
 
309 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  51.48 
 
 
310 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  51.15 
 
 
310 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  50 
 
 
309 aa  322  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  51.15 
 
 
310 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  51.48 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  51.15 
 
 
310 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.32 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  49.02 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.03 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.83 
 
 
320 aa  319  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  53.07 
 
 
302 aa  319  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  50.17 
 
 
320 aa  319  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  54.18 
 
 
319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  48.34 
 
 
350 aa  318  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50 
 
 
320 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  50 
 
 
342 aa  318  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49 
 
 
319 aa  318  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  47.39 
 
 
309 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  48.84 
 
 
313 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  53.28 
 
 
332 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.85 
 
 
305 aa  316  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.43 
 
 
306 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.43 
 
 
306 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  49.83 
 
 
372 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  47.68 
 
 
350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  49.03 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.99 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.41 
 
 
320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.51 
 
 
302 aa  312  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  49.83 
 
 
320 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.88 
 
 
310 aa  311  7.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  47.52 
 
 
305 aa  311  9e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.25 
 
 
351 aa  311  9e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.37 
 
 
330 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.51 
 
 
356 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  47.27 
 
 
324 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 
339 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  51.45 
 
 
308 aa  308  5e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  51.43 
 
 
310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  47.37 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.48 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
335 aa  305  4.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  50 
 
 
316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.52 
 
 
321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.71 
 
 
302 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.54 
 
 
327 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  49.83 
 
 
457 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.52 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  47.65 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  50.53 
 
 
342 aa  302  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  44.92 
 
 
316 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.17 
 
 
315 aa  301  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.66 
 
 
312 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.58 
 
 
325 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  47.19 
 
 
331 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.99 
 
 
330 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0585  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.98 
 
 
320 aa  299  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.44335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>