More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0902 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0902  ATPase  100 
 
 
335 aa  658    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  94.33 
 
 
335 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  75.94 
 
 
325 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.31 
 
 
336 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1589  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.61 
 
 
341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0629676  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  65.73 
 
 
332 aa  418  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  67.3 
 
 
340 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.78 
 
 
324 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.76 
 
 
387 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.44 
 
 
327 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.31 
 
 
317 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  60.88 
 
 
320 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  60.88 
 
 
320 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  62.17 
 
 
320 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  60.57 
 
 
320 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  62.83 
 
 
317 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  60.38 
 
 
320 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.44 
 
 
310 aa  371  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.27 
 
 
324 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  60.32 
 
 
335 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  62.34 
 
 
318 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  60.97 
 
 
318 aa  344  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  53.92 
 
 
319 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.97 
 
 
319 aa  333  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.53 
 
 
327 aa  328  6e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.08 
 
 
318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  52.53 
 
 
305 aa  326  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.9 
 
 
326 aa  325  9e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  52.19 
 
 
305 aa  323  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0253  ATPase  50.94 
 
 
329 aa  322  7e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.28 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.65 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.77 
 
 
322 aa  318  7e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2037  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.59 
 
 
316 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.46 
 
 
335 aa  316  5e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  46.41 
 
 
318 aa  315  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.77 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  47.99 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  53.14 
 
 
302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  51.67 
 
 
310 aa  312  4.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  51.32 
 
 
323 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  46.2 
 
 
314 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  50 
 
 
347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
317 aa  306  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.34 
 
 
318 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.57 
 
 
314 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1283  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.94 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000785499  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  47.92 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1090  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.27 
 
 
327 aa  302  5.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0910  ATPase  49.84 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.43 
 
 
313 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  53.18 
 
 
329 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2110  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.15 
 
 
400 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.625563  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  53.18 
 
 
329 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  53.18 
 
 
329 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  52.81 
 
 
302 aa  300  2e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.19 
 
 
321 aa  299  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.63 
 
 
403 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.48 
 
 
308 aa  299  5e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.23 
 
 
326 aa  298  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1882  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 
321 aa  298  8e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.99 
 
 
322 aa  297  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  53.76 
 
 
316 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1693  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.72 
 
 
321 aa  296  5e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.22 
 
 
315 aa  294  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.82 
 
 
328 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.45 
 
 
314 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  50.47 
 
 
331 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  49.49 
 
 
317 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  51.84 
 
 
320 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  52.84 
 
 
336 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  51.84 
 
 
358 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.61 
 
 
316 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0585  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.22 
 
 
320 aa  290  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.44335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.66 
 
 
327 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.95 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.37 
 
 
341 aa  289  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.95 
 
 
320 aa  288  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  44.12 
 
 
320 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  45.39 
 
 
330 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  44.12 
 
 
320 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  51.5 
 
 
353 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  48.04 
 
 
326 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  51.82 
 
 
324 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  45.95 
 
 
320 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  45.95 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.69 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  46.48 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  43 
 
 
312 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.83 
 
 
331 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  46.1 
 
 
457 aa  286  4e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  45.97 
 
 
318 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.71 
 
 
321 aa  285  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.1 
 
 
320 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.36 
 
 
317 aa  285  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  45.49 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.95 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  52.82 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>