More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4318 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 317 aa  637    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.16 
 
 		 325 aa  524  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  70.79 
 
 		 330 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.72 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  56.05 
 
 		 315 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  55.08 
 
 		 333 aa  355  6.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  52.72 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  54.66 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.33 
 
 		 350 aa  350  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.75 
 
 		 333 aa  345  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.35 
 
 		 329 aa  345  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.35 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  53.77 
 
 		 334 aa  343  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  53.62 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  52.6 
 
 		 337 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  51.13 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.38 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.01 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.88 
 
 		 333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.47 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.48 
 
 		 332 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.52 
 
 		 350 aa  335  7.999999999999999e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.29 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  49.22 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  50.49 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.9 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  53.25 
 
 		 332 aa  331  8e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  50.49 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  52.61 
 
 		 332 aa  329  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  51.66 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.38 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.05 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  50.48 
 
 		 340 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.75 
 
 		 332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  50.16 
 
 		 339 aa  324  9e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 		 378 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  49.69 
 
 		 335 aa  322  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  49.84 
 
 		 345 aa  322  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  52.06 
 
 		 328 aa  322  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.37 
 
 		 318 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  52.35 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  52.04 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  49.35 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  50.65 
 
 		 316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  49.69 
 
 		 318 aa  319  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  50.83 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  49.22 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  49.22 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  49.22 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  50.17 
 
 		 345 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  48.59 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.11 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.9 
 
 		 353 aa  316  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  47.59 
 
 		 371 aa  315  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  51.8 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  46.71 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  46.95 
 
 		 370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  48.23 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  47.87 
 
 		 345 aa  311  7.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  47.96 
 
 		 318 aa  311  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  47.95 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  48.44 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  50.16 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  49.17 
 
 		 318 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  49.38 
 
 		 318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  49.52 
 
 		 318 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.23 
 
 		 432 aa  309  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  49.17 
 
 		 319 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.75 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  48.84 
 
 		 319 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  48.53 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  48.84 
 
 		 319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  48.53 
 
 		 326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  49.05 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  45.43 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  49.17 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.21 
 
 		 329 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  48.84 
 
 		 319 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  49.49 
 
 		 369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  48.21 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  48.84 
 
 		 319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  48.84 
 
 		 319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  50.48 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  48.09 
 
 		 335 aa  302  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  45.22 
 
 		 377 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.54 
 
 		 336 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  46.93 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  48.71 
 
 		 348 aa  301  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  45.96 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.73 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  45.86 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  48.09 
 
 		 325 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  45.45 
 
 		 332 aa  298  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  44.9 
 
 		 390 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  49.33 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  44.9 
 
 		 390 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>