More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0222 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
332 aa  672    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  78.61 
 
 
332 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  79.52 
 
 
332 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  77.11 
 
 
332 aa  534  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  74.1 
 
 
332 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.18 
 
 
332 aa  478  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.66 
 
 
333 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.05 
 
 
331 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  54.52 
 
 
331 aa  382  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.32 
 
 
329 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.32 
 
 
329 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  54.27 
 
 
325 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.78 
 
 
342 aa  364  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  53.35 
 
 
334 aa  363  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.58 
 
 
333 aa  361  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55 
 
 
350 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  51.67 
 
 
333 aa  359  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  53.78 
 
 
327 aa  358  5e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.35 
 
 
327 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.04 
 
 
325 aa  345  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  52.45 
 
 
328 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  52.91 
 
 
328 aa  341  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.38 
 
 
317 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.61 
 
 
329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  53.59 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  50.46 
 
 
340 aa  333  3e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.53 
 
 
329 aa  331  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  49.36 
 
 
315 aa  328  6e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.4 
 
 
354 aa  326  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  51.42 
 
 
337 aa  325  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  50.16 
 
 
324 aa  325  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.96 
 
 
350 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  49.4 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  48.48 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  50.79 
 
 
337 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.95 
 
 
344 aa  315  9e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  50.48 
 
 
345 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  50.81 
 
 
318 aa  308  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  48.7 
 
 
316 aa  308  9e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.36 
 
 
432 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  49.69 
 
 
344 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  48.75 
 
 
345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  49.21 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  47.46 
 
 
331 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  47.88 
 
 
318 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  47.46 
 
 
331 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  46.95 
 
 
339 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.25 
 
 
378 aa  299  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  46.69 
 
 
345 aa  299  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  48.1 
 
 
321 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  49.69 
 
 
318 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  47.62 
 
 
334 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  47 
 
 
320 aa  295  9e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  47.28 
 
 
339 aa  294  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  48.22 
 
 
320 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  45.37 
 
 
347 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  49.51 
 
 
325 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  48.26 
 
 
318 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  47.76 
 
 
377 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  47.6 
 
 
315 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  49.51 
 
 
323 aa  291  7e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  47.95 
 
 
318 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  47.95 
 
 
318 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  47.95 
 
 
318 aa  291  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  46.27 
 
 
363 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  44.89 
 
 
333 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  44.89 
 
 
333 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  44.89 
 
 
333 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  48.11 
 
 
318 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  42.9 
 
 
353 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  47.48 
 
 
318 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  49.51 
 
 
319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  45.37 
 
 
333 aa  288  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  47.81 
 
 
326 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  47.32 
 
 
316 aa  288  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  49.19 
 
 
319 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  47.32 
 
 
318 aa  288  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  48.06 
 
 
324 aa  288  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  43.94 
 
 
325 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  47.34 
 
 
326 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  47.48 
 
 
318 aa  288  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.37 
 
 
356 aa  288  8e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  47.32 
 
 
335 aa  288  8e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.06 
 
 
353 aa  288  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.14 
 
 
360 aa  288  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  46.86 
 
 
321 aa  288  9e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  47.02 
 
 
319 aa  288  9e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.41 
 
 
362 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  48.87 
 
 
319 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.08 
 
 
347 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.305004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  47 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  48.87 
 
 
319 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  47.81 
 
 
369 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  43.88 
 
 
329 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  47 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  43.88 
 
 
329 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  47 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  43.88 
 
 
329 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  47.17 
 
 
370 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>