More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1243 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 337 aa  677    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  85.98 
 
 		 344 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  82.44 
 
 		 339 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  77.99 
 
 		 345 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  75.55 
 
 		 337 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  76.16 
 
 		 345 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.95 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60 
 
 		 350 aa  391  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  60.12 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  60.44 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.42 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.01 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  58.15 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.36 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  55.11 
 
 		 331 aa  361  1e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  55.08 
 
 		 334 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  53.5 
 
 		 325 aa  358  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.49 
 
 		 360 aa  358  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  57.14 
 
 		 369 aa  358  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.15 
 
 		 331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  54.1 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.34 
 
 		 353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  53.33 
 
 		 377 aa  352  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.11 
 
 		 346 aa  350  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.05 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  54.19 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  53.55 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  53.55 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  53.55 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  53.55 
 
 		 385 aa  345  8e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  54.02 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.24 
 
 		 396 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.46 
 
 		 333 aa  341  9e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.13 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  54.97 
 
 		 348 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  52.7 
 
 		 328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.49 
 
 		 362 aa  338  7e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  53.73 
 
 		 369 aa  338  9e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  53.65 
 
 		 324 aa  337  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.44 
 
 		 342 aa  335  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  53.44 
 
 		 327 aa  335  9e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  54.9 
 
 		 332 aa  333  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  53.05 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.98 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.56 
 
 		 336 aa  332  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  48.87 
 
 		 315 aa  331  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.6 
 
 		 329 aa  329  5.0000000000000004e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  50.49 
 
 		 328 aa  328  9e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.89 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  57.19 
 
 		 400 aa  326  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.61 
 
 		 332 aa  325  9e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.51 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.48 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  53.63 
 
 		 346 aa  322  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.18 
 
 		 329 aa  322  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  47.77 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.15 
 
 		 332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 		 332 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  48.54 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.15 
 
 		 332 aa  318  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.1 
 
 		 327 aa  315  9e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  50.16 
 
 		 335 aa  311  7.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  46.88 
 
 		 316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  51.31 
 
 		 332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  50.47 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  50.32 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.01 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  48.18 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  47.95 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  48.18 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  48.18 
 
 		 333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  50.32 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  50.32 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.25 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  50.32 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  50.32 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  50.32 
 
 		 318 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  50.17 
 
 		 318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  50.65 
 
 		 318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  48.4 
 
 		 323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  50 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.37 
 
 		 347 aa  302  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.305004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  49.68 
 
 		 316 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0879  ATPase  49.17 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.714074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  49.35 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.52 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  49.35 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  49.35 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  48.41 
 
 		 321 aa  299  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  49.39 
 
 		 347 aa  299  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  48.53 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  49.05 
 
 		 321 aa  298  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  49.84 
 
 		 331 aa  298  9e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  48.42 
 
 		 331 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  46.86 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  50.67 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  50.67 
 
 		 326 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  50 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  49.18 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>