More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3320 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  100 
 
 		 347 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  83.82 
 
 		 335 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  83.24 
 
 		 335 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  80.06 
 
 		 346 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  84.5 
 
 		 333 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  78.8 
 
 		 349 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  81.42 
 
 		 328 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  60.83 
 
 		 325 aa  411  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.24 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  50.82 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 		 319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.98 
 
 		 321 aa  316  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.78 
 
 		 321 aa  315  9e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.37 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  44.01 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  44.81 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  51.21 
 
 		 329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  51.21 
 
 		 329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  51.21 
 
 		 329 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 		 326 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  52.44 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  50 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.6 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  47.97 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  48.13 
 
 		 358 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.62 
 
 		 331 aa  301  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  46.2 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  48.07 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.71 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  47.1 
 
 		 315 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  49.39 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  42.81 
 
 		 328 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  48.54 
 
 		 316 aa  299  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.75 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.03 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  42.09 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  46.01 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  47.28 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  47.76 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  49.35 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  48.07 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  49.26 
 
 		 340 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  46.97 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  46.74 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  48.44 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.27 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  48.39 
 
 		 315 aa  293  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.37 
 
 		 342 aa  292  7e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  50.98 
 
 		 346 aa  291  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.53 
 
 		 354 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  47.13 
 
 		 320 aa  291  9e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.09 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.83 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.12 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.05 
 
 		 350 aa  289  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.73 
 
 		 329 aa  288  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  43.5 
 
 		 327 aa  288  7e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.86 
 
 		 325 aa  288  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  49.06 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.95 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.15 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  48.69 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  49.07 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  46.65 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  47.2 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  46.65 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  49.36 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.09 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  46.65 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  50.97 
 
 		 318 aa  286  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  50 
 
 		 320 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  47.91 
 
 		 318 aa  285  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.89 
 
 		 327 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  48.44 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  43.43 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  47 
 
 		 318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  44.27 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.58 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0759  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  49.38 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  47.22 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.41 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  44.41 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  44.1 
 
 		 457 aa  282  6.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.19 
 
 		 313 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  41.53 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  42.33 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  45.93 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.15 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.57 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  48.87 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.19 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  42.04 
 
 		 312 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  45.13 
 
 		 317 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  47.92 
 
 		 334 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.06 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  45.22 
 
 		 371 aa  278  9e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>