More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2442 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
329 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  97.87 
 
 
329 aa  624  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.73 
 
 
342 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.85 
 
 
331 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  55.59 
 
 
327 aa  381  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.32 
 
 
332 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.87 
 
 
333 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.32 
 
 
332 aa  378  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  57.5 
 
 
325 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.56 
 
 
332 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  54.6 
 
 
332 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  56.83 
 
 
332 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  52.32 
 
 
331 aa  365  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.97 
 
 
332 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.39 
 
 
350 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  53.07 
 
 
333 aa  364  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  51.85 
 
 
334 aa  361  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.23 
 
 
333 aa  358  8e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  50.32 
 
 
330 aa  348  9e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.62 
 
 
317 aa  346  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  54.75 
 
 
328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.08 
 
 
327 aa  338  9e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  52.06 
 
 
345 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  53.65 
 
 
339 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  50.16 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  51.88 
 
 
344 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  54.43 
 
 
345 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  48.77 
 
 
328 aa  328  7e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  52.08 
 
 
337 aa  328  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  52.27 
 
 
324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.29 
 
 
344 aa  325  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.74 
 
 
378 aa  325  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  47.68 
 
 
340 aa  325  7e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  53.44 
 
 
337 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.55 
 
 
329 aa  322  4e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.82 
 
 
329 aa  320  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.09 
 
 
356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 
432 aa  318  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  51.95 
 
 
318 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.05 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  49.84 
 
 
318 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  49.21 
 
 
345 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  51.63 
 
 
347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  51.62 
 
 
318 aa  309  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  49.84 
 
 
318 aa  309  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  47.62 
 
 
339 aa  309  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  50.16 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  51.48 
 
 
371 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.38 
 
 
322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  52.16 
 
 
319 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  51.85 
 
 
319 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  51.85 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  51.85 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  51.85 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  51.52 
 
 
319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  50 
 
 
318 aa  305  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  50.81 
 
 
335 aa  305  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  51.52 
 
 
319 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  49.18 
 
 
377 aa  305  6e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  48.75 
 
 
326 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  48.75 
 
 
326 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  47.27 
 
 
323 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  49.84 
 
 
318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  51.15 
 
 
370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  48.16 
 
 
385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  50.33 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  49.38 
 
 
319 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  51.34 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  50.49 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  50.49 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  50.49 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  47.85 
 
 
386 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  50.65 
 
 
331 aa  301  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.32 
 
 
325 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
335 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  50.65 
 
 
331 aa  301  9e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  47.32 
 
 
333 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  49.68 
 
 
318 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  50.16 
 
 
316 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  49.68 
 
 
318 aa  300  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  50.33 
 
 
320 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  48.7 
 
 
318 aa  299  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  46.93 
 
 
390 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  46.93 
 
 
390 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  46.93 
 
 
390 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  51.52 
 
 
319 aa  298  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  49.84 
 
 
318 aa  298  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  49.84 
 
 
318 aa  298  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  49.84 
 
 
318 aa  298  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.75 
 
 
346 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  49.67 
 
 
333 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  49.67 
 
 
333 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  45.71 
 
 
319 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  49.67 
 
 
333 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  51.03 
 
 
369 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>