More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2169 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  100 
 
 
318 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  85.22 
 
 
335 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  84.91 
 
 
318 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  84.91 
 
 
318 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  84.91 
 
 
318 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  84.91 
 
 
318 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  84.28 
 
 
318 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  84.91 
 
 
318 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  84.91 
 
 
318 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  84.91 
 
 
318 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  84.28 
 
 
318 aa  555  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  84.28 
 
 
318 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  83.33 
 
 
318 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  84.18 
 
 
316 aa  549  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  82.08 
 
 
318 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  82.39 
 
 
318 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  66.46 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  63.86 
 
 
333 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  66.14 
 
 
318 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  64.87 
 
 
318 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  62.78 
 
 
321 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  65.93 
 
 
318 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  65.62 
 
 
318 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  64.26 
 
 
319 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  63.61 
 
 
347 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  64.65 
 
 
326 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  64.65 
 
 
326 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  64.84 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  64.84 
 
 
319 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  64.52 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  64.52 
 
 
319 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  64.19 
 
 
319 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  63.87 
 
 
319 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  61.83 
 
 
318 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  64.52 
 
 
319 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  64.19 
 
 
319 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  63.58 
 
 
331 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  63.58 
 
 
331 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  65.16 
 
 
319 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  61.34 
 
 
320 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  59.87 
 
 
323 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.23 
 
 
356 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  58.15 
 
 
324 aa  360  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  56.78 
 
 
339 aa  360  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  54.31 
 
 
320 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  55.8 
 
 
326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  54.09 
 
 
332 aa  354  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  53.31 
 
 
321 aa  346  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.05 
 
 
325 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  55.06 
 
 
325 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  54.34 
 
 
325 aa  339  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  54.4 
 
 
322 aa  338  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  55.24 
 
 
323 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  50.79 
 
 
324 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  50.48 
 
 
329 aa  318  7.999999999999999e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.72 
 
 
331 aa  316  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  51.46 
 
 
319 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  49.2 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.95 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.23 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.8 
 
 
329 aa  308  9e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  50.32 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  50.32 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  51.62 
 
 
331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  48.42 
 
 
333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  48.42 
 
 
333 aa  305  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.1 
 
 
350 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  48.1 
 
 
333 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  48.38 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  48.38 
 
 
333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  47.13 
 
 
325 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  51.79 
 
 
323 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3275  MoxR-like ATPase  51.47 
 
 
323 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  47.19 
 
 
330 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 
342 aa  299  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.02 
 
 
325 aa  298  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  49.35 
 
 
330 aa  298  9e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 
330 aa  298  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 
331 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  47.1 
 
 
330 aa  296  2e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  49.18 
 
 
337 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  49.21 
 
 
324 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.7 
 
 
333 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  52.92 
 
 
318 aa  295  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.39 
 
 
317 aa  295  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.77 
 
 
333 aa  293  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  49.84 
 
 
339 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  46.35 
 
 
340 aa  291  7e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  43.4 
 
 
315 aa  290  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  48.85 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  50.94 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47.91 
 
 
328 aa  288  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.34 
 
 
329 aa  288  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  49.52 
 
 
335 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  49.01 
 
 
328 aa  288  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
335 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  49.03 
 
 
337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.84 
 
 
329 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.44 
 
 
432 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.05 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>