More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1125 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1125  ATPase  100 
 
 		 332 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3275  MoxR-like ATPase  71.21 
 
 		 323 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  71.52 
 
 		 323 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  63.23 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.79 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.18 
 
 		 331 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  61.79 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  64.29 
 
 		 318 aa  362  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.45 
 
 		 338 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  64.45 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.04 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  53.51 
 
 		 318 aa  311  9e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  50.97 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  50.17 
 
 		 319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  53.16 
 
 		 318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  50.65 
 
 		 318 aa  305  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.77 
 
 		 339 aa  305  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  47.76 
 
 		 323 aa  305  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  52.51 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  50.94 
 
 		 318 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  49.34 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  48.31 
 
 		 333 aa  302  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  48.51 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  52.17 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.63 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  52.17 
 
 		 316 aa  299  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  48.17 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  48.17 
 
 		 331 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  50 
 
 		 321 aa  298  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  49.5 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  52.17 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  52.17 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  52.17 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.17 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  50.84 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  52.17 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  51.84 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  51.84 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  51.84 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  51.17 
 
 		 318 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  49.33 
 
 		 319 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  49.33 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  49.33 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  49.33 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  50.84 
 
 		 318 aa  295  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  49.33 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  49.33 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  49.33 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  49.33 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  49.33 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  49.68 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  47.88 
 
 		 319 aa  288  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.16 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  47.62 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  41.96 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  50.49 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  48.53 
 
 		 319 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  46.1 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.18 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  45.12 
 
 		 332 aa  271  9e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  47.85 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.34 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  46.06 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  48.73 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  47.55 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  48.1 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.37 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 353 aa  268  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  50.83 
 
 		 324 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  47.8 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.26 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  44.34 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.58 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  47.87 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  48.71 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.64 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  47.08 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.22 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  45.81 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.61 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.97 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  45.13 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.2 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.28 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  46.13 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  49.66 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  47 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  48.21 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.16 
 
 		 332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  45.94 
 
 		 302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.01 
 
 		 325 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.87 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.87 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.64 
 
 		 333 aa  258  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  44.16 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  46.41 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  39.81 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  45.33 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  46.56 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  43.42 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>