More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000309 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  100 
 
 
327 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  68.71 
 
 
333 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  69.38 
 
 
333 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  68.75 
 
 
333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  64.11 
 
 
332 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  55.7 
 
 
326 aa  355  7.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.01 
 
 
325 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  52.6 
 
 
347 aa  352  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  52.23 
 
 
320 aa  351  8e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  54.18 
 
 
321 aa  351  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  53.61 
 
 
318 aa  346  3e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  50.77 
 
 
331 aa  345  8e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  50.46 
 
 
331 aa  344  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  55.02 
 
 
318 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  54.26 
 
 
318 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  52.81 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  54.26 
 
 
325 aa  342  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  51.39 
 
 
326 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  51.39 
 
 
326 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  51.77 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  56.15 
 
 
323 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  50.46 
 
 
319 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  52.94 
 
 
320 aa  335  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  50.46 
 
 
319 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  50.46 
 
 
319 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  53.23 
 
 
325 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  51.25 
 
 
321 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  49.85 
 
 
319 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  50.3 
 
 
333 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  51.13 
 
 
319 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  53.72 
 
 
318 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  50.46 
 
 
319 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  51.13 
 
 
319 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  49.85 
 
 
318 aa  331  9e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  51.74 
 
 
318 aa  330  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.26 
 
 
356 aa  329  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  48.17 
 
 
319 aa  328  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  51.61 
 
 
319 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  50.78 
 
 
318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  51.61 
 
 
335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  51.61 
 
 
318 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  51.61 
 
 
318 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.61 
 
 
318 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  51.61 
 
 
318 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  50.97 
 
 
316 aa  324  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  50.97 
 
 
318 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  50.97 
 
 
318 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  50.97 
 
 
318 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  48.77 
 
 
323 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  50.97 
 
 
318 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.32 
 
 
339 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  50 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  51.3 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  47.65 
 
 
318 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  48.59 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  49.2 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  47.37 
 
 
319 aa  309  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  47.6 
 
 
331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.92 
 
 
333 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  49.69 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  50.62 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  48.14 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.96 
 
 
317 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.5 
 
 
325 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.71 
 
 
329 aa  299  5e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.75 
 
 
330 aa  298  6e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
331 aa  298  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.97 
 
 
342 aa  296  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  46.11 
 
 
327 aa  296  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.05 
 
 
332 aa  295  8e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  46.13 
 
 
325 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.08 
 
 
333 aa  293  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  45.86 
 
 
333 aa  290  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.77 
 
 
432 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  45.89 
 
 
334 aa  288  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.37 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  47.47 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.52 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  45.45 
 
 
335 aa  282  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.43 
 
 
353 aa  281  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.3 
 
 
336 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  48.1 
 
 
332 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  44.31 
 
 
385 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 
318 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  43.56 
 
 
386 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.39 
 
 
329 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.12 
 
 
332 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  44.14 
 
 
330 aa  277  2e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  43.61 
 
 
345 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  45.25 
 
 
332 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  43.57 
 
 
337 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.95 
 
 
378 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  43.38 
 
 
390 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  43.38 
 
 
390 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  43.38 
 
 
390 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  44.65 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.72 
 
 
322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  41.8 
 
 
377 aa  272  6e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44 
 
 
335 aa  272  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  47.8 
 
 
345 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>