More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3559 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  98.8 
 
 		 333 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  98.8 
 
 		 333 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  100 
 
 		 333 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  68.75 
 
 		 327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  58.68 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  54.35 
 
 		 321 aa  342  5e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  55.45 
 
 		 324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  51.57 
 
 		 331 aa  339  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  51.57 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  51.75 
 
 		 320 aa  339  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  53.4 
 
 		 318 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  54.19 
 
 		 318 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  51.85 
 
 		 326 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.46 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  50.91 
 
 		 333 aa  333  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  54.52 
 
 		 318 aa  330  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  52.08 
 
 		 318 aa  329  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  52.91 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  49.7 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  52.41 
 
 		 318 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  52.5 
 
 		 325 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  50.94 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  51.6 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  51.45 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  50.62 
 
 		 320 aa  317  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  50.31 
 
 		 319 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  315  8e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  50.31 
 
 		 319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  48.73 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  49.84 
 
 		 319 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.93 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  50.16 
 
 		 319 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  49.69 
 
 		 319 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  49.69 
 
 		 319 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  49.53 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  53.77 
 
 		 323 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  49.37 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  49.53 
 
 		 319 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  50.32 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  49.84 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  49.2 
 
 		 318 aa  309  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.55 
 
 		 318 aa  309  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  49.84 
 
 		 318 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  49.84 
 
 		 318 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 318 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  49.84 
 
 		 318 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  49.05 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  48.1 
 
 		 319 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  49.51 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  49.51 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  49.51 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  48.1 
 
 		 318 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  47.27 
 
 		 339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  46.88 
 
 		 330 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.38 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  49.37 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  51.55 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  50.46 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.96 
 
 		 325 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.35 
 
 		 342 aa  292  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  48.7 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  47.15 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.89 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  46.11 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  44.58 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.14 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.31 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.97 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  47.65 
 
 		 335 aa  286  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  44.72 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.33 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.64 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  46.79 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  47.76 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.28 
 
 		 322 aa  279  6e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  46.58 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  45.28 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  46.84 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  47.34 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  46.39 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.71 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.15 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  42.04 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.91 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.16 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.94 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  46.2 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  43.37 
 
 		 390 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  47.8 
 
 		 319 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  43.37 
 
 		 390 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  43.37 
 
 		 390 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.06 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.6 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  44.88 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  46.5 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  45.22 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>