More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3798 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3798  ATPase  100 
 
 		 323 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.69 
 
 		 325 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  70.03 
 
 		 326 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  71.38 
 
 		 325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  60.52 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  58.57 
 
 		 324 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  59.82 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  59.44 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  59.19 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  59.44 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  59.82 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  59.44 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  58.82 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  59.18 
 
 		 320 aa  388  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  59.82 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  59.82 
 
 		 319 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  59.43 
 
 		 325 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  57.55 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  58.26 
 
 		 321 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  56.04 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  59.19 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  55.42 
 
 		 333 aa  381  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  57.56 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  57.59 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  56.11 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  56.48 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  55.9 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  55.9 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  55.25 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  55.28 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  59.44 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  57.32 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  53.97 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  55.87 
 
 		 318 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  55.87 
 
 		 318 aa  361  8e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  55.31 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  55.24 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  55.56 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  55.56 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  55.56 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  55.87 
 
 		 335 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  56.15 
 
 		 327 aa  359  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  54.92 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.56 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  55.56 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  55.56 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  55.56 
 
 		 318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  55.24 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  54.6 
 
 		 318 aa  351  8e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  53.33 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  52.83 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  52.83 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  54.81 
 
 		 339 aa  341  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  56.27 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.19 
 
 		 356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  53.77 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  53.77 
 
 		 333 aa  332  5e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  53.46 
 
 		 333 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.53 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  52.75 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  46.71 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  51.42 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.89 
 
 		 333 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  49.38 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.47 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 		 350 aa  312  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.1 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  46.86 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.62 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  48.89 
 
 		 327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.73 
 
 		 325 aa  305  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.3 
 
 		 329 aa  305  7e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.81 
 
 		 353 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  46.98 
 
 		 334 aa  305  9.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  47.35 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  50.16 
 
 		 322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.94 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  48.58 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  47.94 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.56 
 
 		 317 aa  299  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  51.46 
 
 		 339 aa  298  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  50.33 
 
 		 337 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.13 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  50 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.26 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  50.65 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  47.13 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  47.46 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  49.68 
 
 		 344 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  50.16 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  45.25 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  50 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  50.16 
 
 		 385 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.99 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  49.35 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  49.2 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  49.2 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  49.2 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.71 
 
 		 332 aa  288  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>