More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3245 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  100 
 
 
339 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  91.21 
 
 
344 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  82.44 
 
 
337 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  80.79 
 
 
345 aa  538  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  80.82 
 
 
345 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  75.15 
 
 
337 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  62.97 
 
 
371 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  61.23 
 
 
370 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.12 
 
 
350 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.49 
 
 
344 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.36 
 
 
378 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.88 
 
 
354 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.31 
 
 
432 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  58.47 
 
 
345 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  57.64 
 
 
369 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.45 
 
 
396 aa  359  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  52.89 
 
 
325 aa  358  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.87 
 
 
360 aa  355  6.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.01 
 
 
353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  56.77 
 
 
369 aa  352  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.39 
 
 
346 aa  352  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  54.11 
 
 
386 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  52.45 
 
 
377 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  56.77 
 
 
348 aa  348  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  53.67 
 
 
385 aa  348  6e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.92 
 
 
362 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  52.45 
 
 
339 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  54.07 
 
 
390 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  54.07 
 
 
390 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  54.07 
 
 
390 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  55.67 
 
 
331 aa  345  6e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  50.8 
 
 
315 aa  345  6e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.55 
 
 
331 aa  343  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.25 
 
 
325 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  52.46 
 
 
334 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  53.42 
 
 
334 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  57.78 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  51.15 
 
 
333 aa  333  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.04 
 
 
329 aa  333  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  51.15 
 
 
328 aa  332  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  50.81 
 
 
330 aa  332  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  52.55 
 
 
324 aa  332  7.000000000000001e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.85 
 
 
329 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.19 
 
 
336 aa  331  8e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  52.22 
 
 
328 aa  331  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 
317 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 
333 aa  329  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.18 
 
 
329 aa  328  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  53.11 
 
 
327 aa  328  9e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  49.04 
 
 
340 aa  326  3e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  54.58 
 
 
332 aa  325  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.81 
 
 
350 aa  325  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  53.85 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.48 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.82 
 
 
332 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.8 
 
 
333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.48 
 
 
329 aa  316  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  52.27 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.3 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.31 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  52.15 
 
 
318 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  52.27 
 
 
318 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.27 
 
 
318 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  52.27 
 
 
318 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  52.27 
 
 
318 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  51.95 
 
 
318 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  51.95 
 
 
318 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  51.95 
 
 
318 aa  311  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  51.94 
 
 
318 aa  311  9e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  51.46 
 
 
320 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  51.62 
 
 
316 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  51.1 
 
 
332 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  48.42 
 
 
363 aa  309  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  47.46 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  51.47 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  50.49 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.21 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  51.3 
 
 
318 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  50.97 
 
 
318 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  49.36 
 
 
318 aa  302  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.56 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 
322 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  51.52 
 
 
326 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  51.52 
 
 
326 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  47.18 
 
 
320 aa  299  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  48.57 
 
 
321 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  47.73 
 
 
319 aa  299  6e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  50.49 
 
 
318 aa  298  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  46.86 
 
 
325 aa  298  9e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  48 
 
 
331 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  47.99 
 
 
331 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  47.91 
 
 
318 aa  296  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  49.83 
 
 
318 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  49.69 
 
 
335 aa  296  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  48.51 
 
 
333 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  48.51 
 
 
333 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  48.51 
 
 
333 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  46.71 
 
 
328 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  49.84 
 
 
318 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>