More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2472 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 335 aa  664    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.24 
 
 		 331 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.92 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  65.92 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  64.87 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  66.77 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.14 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  63.34 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3275  MoxR-like ATPase  63.02 
 
 		 323 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  63.04 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  60.32 
 
 		 318 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  52.09 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  52.09 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  51.77 
 
 		 319 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  51.43 
 
 		 320 aa  311  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  51.28 
 
 		 318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  52.46 
 
 		 326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  51.77 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  52.13 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  51.77 
 
 		 319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  51.45 
 
 		 319 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  51.45 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  51.45 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  50.97 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  51.45 
 
 		 318 aa  301  8.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  49.36 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  49.52 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  49.68 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  47.77 
 
 		 318 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  48.72 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  50 
 
 		 318 aa  295  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  50.8 
 
 		 318 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.94 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  50.95 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  50.95 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  49.01 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  48.72 
 
 		 318 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  47.88 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  52.09 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.32 
 
 		 339 aa  291  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  47.69 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  50.32 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.85 
 
 		 318 aa  288  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  49.37 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  49.05 
 
 		 335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  49.05 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.05 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  49.05 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  49.05 
 
 		 318 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  47.44 
 
 		 318 aa  285  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  48.72 
 
 		 316 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  49.19 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  50.81 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  45.78 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.86 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  44.13 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  48.57 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  48.56 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  48.1 
 
 		 333 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  48 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  47.94 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  46 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  47.94 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  46.88 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  46.46 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  46.44 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  48.28 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.39 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  46.69 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.33 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  45.36 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  46.01 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  39.94 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.06 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  45.05 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.67 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.67 
 
 		 432 aa  255  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.34 
 
 		 329 aa  255  7e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  45.36 
 
 		 339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.47 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  47.16 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.33 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  45.69 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.31 
 
 		 333 aa  252  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.37 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  46.36 
 
 		 331 aa  251  9.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  47.02 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  45.33 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.67 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  46.84 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.84 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.53 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  43.52 
 
 		 340 aa  249  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.46 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.35 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>