More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0048 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
318 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  54.37 
 
 
329 aa  353  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.2 
 
 
322 aa  351  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  56.74 
 
 
320 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  55.56 
 
 
318 aa  334  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  54.66 
 
 
321 aa  332  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  55.91 
 
 
318 aa  331  8e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  56.55 
 
 
318 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  56.55 
 
 
335 aa  330  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.55 
 
 
318 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  56.55 
 
 
318 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  56.55 
 
 
318 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  55.91 
 
 
318 aa  329  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  55.91 
 
 
318 aa  328  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  55.59 
 
 
316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  51.1 
 
 
319 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  53.04 
 
 
318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  54.95 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  55.91 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  53.27 
 
 
331 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  53.27 
 
 
331 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  54.49 
 
 
347 aa  325  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  55.27 
 
 
318 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  55.27 
 
 
318 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  55.27 
 
 
318 aa  325  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  54.95 
 
 
318 aa  325  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  54.46 
 
 
325 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  52.8 
 
 
319 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  55 
 
 
339 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  52.48 
 
 
319 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  53.02 
 
 
318 aa  322  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  52.17 
 
 
319 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  52.88 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  51.88 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  55.59 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  52.48 
 
 
319 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  51.83 
 
 
333 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  52.48 
 
 
319 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  52.8 
 
 
319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  52.17 
 
 
319 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  54.17 
 
 
326 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  51.22 
 
 
326 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  54.17 
 
 
326 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  50.49 
 
 
320 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  51.3 
 
 
318 aa  316  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.59 
 
 
356 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  49.69 
 
 
321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  51.71 
 
 
319 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.92 
 
 
325 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  48.77 
 
 
325 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  52.48 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.02 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  47.95 
 
 
323 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  48.79 
 
 
327 aa  300  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  46.52 
 
 
315 aa  299  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.9 
 
 
342 aa  300  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  50.62 
 
 
323 aa  299  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.7 
 
 
331 aa  298  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  50.15 
 
 
337 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  49.05 
 
 
324 aa  297  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  48.61 
 
 
344 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.05 
 
 
326 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  47.95 
 
 
332 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  45.37 
 
 
316 aa  293  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  51.46 
 
 
345 aa  292  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  48.22 
 
 
325 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  48.15 
 
 
339 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  49.69 
 
 
327 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  49.35 
 
 
337 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.44 
 
 
318 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  48.74 
 
 
319 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  48.36 
 
 
331 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.53 
 
 
350 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 
317 aa  288  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.11 
 
 
327 aa  288  6e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  53.59 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.99 
 
 
329 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  48.55 
 
 
316 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.66 
 
 
329 aa  285  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  49.52 
 
 
345 aa  285  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.17 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.13 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.44 
 
 
332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  49.24 
 
 
333 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  49.24 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  48.94 
 
 
333 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  45.31 
 
 
333 aa  281  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  47.37 
 
 
324 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  44.16 
 
 
312 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48 
 
 
331 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  50 
 
 
322 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.13 
 
 
325 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  49.36 
 
 
332 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
340 aa  277  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.13 
 
 
332 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  49.69 
 
 
329 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  50.95 
 
 
358 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  48.45 
 
 
342 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  49.69 
 
 
329 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  49.69 
 
 
329 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>