More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1954 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
353 aa  706    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  74.24 
 
 
339 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  72.9 
 
 
334 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.32 
 
 
336 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  71.47 
 
 
346 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  65.57 
 
 
369 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  64.48 
 
 
371 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  64.35 
 
 
370 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.07 
 
 
378 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.99 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  60.96 
 
 
386 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  64.17 
 
 
345 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  67.18 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.31 
 
 
346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  61.13 
 
 
385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  66.56 
 
 
369 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  60.91 
 
 
390 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  60.91 
 
 
390 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  60.91 
 
 
390 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.65 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  58.69 
 
 
377 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  69.01 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.54 
 
 
360 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.65 
 
 
396 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.73 
 
 
344 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.89 
 
 
350 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.42 
 
 
354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  54.34 
 
 
337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  53.01 
 
 
339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  54.6 
 
 
344 aa  351  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  53.38 
 
 
337 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  53.82 
 
 
345 aa  342  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  53.7 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.96 
 
 
350 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  46.28 
 
 
330 aa  318  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.94 
 
 
331 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  50.79 
 
 
325 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  48.69 
 
 
315 aa  318  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.79 
 
 
333 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  47.54 
 
 
333 aa  316  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 
325 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.9 
 
 
317 aa  316  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 
329 aa  316  5e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  46.75 
 
 
334 aa  315  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  49.67 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.21 
 
 
333 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  53.42 
 
 
321 aa  311  7.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  45.05 
 
 
340 aa  311  9e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  50.47 
 
 
331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  48.85 
 
 
327 aa  310  4e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  50.16 
 
 
331 aa  309  5e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  50.32 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  50.48 
 
 
326 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  49.52 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  48.26 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  50.49 
 
 
318 aa  302  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
329 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  50.65 
 
 
318 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  47.87 
 
 
332 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 
325 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  50 
 
 
318 aa  299  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  47.78 
 
 
335 aa  298  9e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  49.19 
 
 
318 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  48.84 
 
 
318 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  46.23 
 
 
328 aa  296  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
332 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  49.17 
 
 
318 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.02 
 
 
327 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  48.56 
 
 
318 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  50 
 
 
320 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  49.33 
 
 
318 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  48.7 
 
 
335 aa  292  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  49.84 
 
 
363 aa  291  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.16 
 
 
329 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.27 
 
 
347 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.305004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  47.43 
 
 
347 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
332 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  50.81 
 
 
323 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  44.75 
 
 
330 aa  290  4e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  42.42 
 
 
326 aa  289  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.38 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  48.38 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  48.38 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  48.38 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.82 
 
 
329 aa  288  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19020  MoxR-like ATPase  51.82 
 
 
377 aa  288  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  48.05 
 
 
318 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.06 
 
 
332 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.73 
 
 
335 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  47.4 
 
 
316 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  48.7 
 
 
318 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  49.83 
 
 
318 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  47.44 
 
 
319 aa  287  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  47.65 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  46.35 
 
 
332 aa  286  4e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.01 
 
 
332 aa  286  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  46.95 
 
 
318 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  46.95 
 
 
318 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  47.87 
 
 
316 aa  286  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>