More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3275 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3275  MoxR-like ATPase  100 
 
 
323 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  99.38 
 
 
323 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  71.21 
 
 
332 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  65.18 
 
 
345 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.9 
 
 
330 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  66.04 
 
 
318 aa  378  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  62.9 
 
 
330 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.42 
 
 
331 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.02 
 
 
335 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.78 
 
 
338 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  64.58 
 
 
357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  53.51 
 
 
318 aa  318  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  52.44 
 
 
347 aa  317  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  53.87 
 
 
318 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  51.06 
 
 
333 aa  316  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  51.47 
 
 
318 aa  315  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  51.47 
 
 
318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  51.47 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  50.81 
 
 
318 aa  311  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  52.17 
 
 
318 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  50.49 
 
 
318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  52.17 
 
 
335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.17 
 
 
318 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  52.17 
 
 
318 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  52.17 
 
 
318 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  52.17 
 
 
318 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  54.58 
 
 
318 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  51.17 
 
 
316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  51.17 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  51.17 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  51.17 
 
 
318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  50 
 
 
323 aa  301  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  52.46 
 
 
318 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  50 
 
 
321 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  48.05 
 
 
319 aa  298  8e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  50.31 
 
 
320 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  49.19 
 
 
318 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.59 
 
 
339 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  49.84 
 
 
331 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  49.84 
 
 
331 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  49.68 
 
 
318 aa  291  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  49.68 
 
 
326 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  49.68 
 
 
326 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  51.01 
 
 
319 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  51.76 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.27 
 
 
356 aa  288  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  50.68 
 
 
319 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  50.68 
 
 
319 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  50.17 
 
 
319 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  50.5 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  50.5 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  49.83 
 
 
319 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.22 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  45.93 
 
 
320 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  48.05 
 
 
319 aa  278  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.21 
 
 
353 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  47.91 
 
 
339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  46.46 
 
 
333 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  47.13 
 
 
333 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  46.71 
 
 
327 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  49.51 
 
 
319 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  46.65 
 
 
339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  48.44 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  48.54 
 
 
321 aa  269  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  45.66 
 
 
327 aa  268  8e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.39 
 
 
378 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.47 
 
 
331 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  46.65 
 
 
333 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
318 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.69 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  48.56 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  44.14 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.33 
 
 
350 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.41 
 
 
302 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  53.2 
 
 
369 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.5 
 
 
322 aa  265  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  44.44 
 
 
328 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  43.73 
 
 
320 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  44.84 
 
 
332 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.36 
 
 
432 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  47.28 
 
 
325 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  48.9 
 
 
369 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  48.73 
 
 
323 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  46.35 
 
 
326 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.21 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  46.62 
 
 
337 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  44.97 
 
 
344 aa  262  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  45.57 
 
 
302 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.27 
 
 
329 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  43.09 
 
 
320 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  45.09 
 
 
337 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  45.31 
 
 
329 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  45.86 
 
 
345 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  43.69 
 
 
302 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.3 
 
 
329 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  47.67 
 
 
386 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  43.91 
 
 
330 aa  260  3e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  44.88 
 
 
320 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  48.5 
 
 
371 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.38 
 
 
342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>