More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1004 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 338 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  91.33 
 
 		 357 aa  567  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  79.64 
 
 		 331 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  80.7 
 
 		 330 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  80.7 
 
 		 330 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  80.38 
 
 		 345 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.14 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3275  MoxR-like ATPase  67.44 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  67.77 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  64.45 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  60.9 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  52.88 
 
 		 321 aa  315  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  52.41 
 
 		 318 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  52.55 
 
 		 320 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  50 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  52.23 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  53 
 
 		 319 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  53 
 
 		 319 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  50.79 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  50.47 
 
 		 331 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  52.92 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  52.12 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  53.57 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  50.81 
 
 		 318 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  50.16 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  53.25 
 
 		 326 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  51.13 
 
 		 318 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  51.62 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.3 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  51.91 
 
 		 319 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  51.13 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  51.59 
 
 		 319 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  51.59 
 
 		 319 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  51.59 
 
 		 319 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  53.23 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.55 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  49.52 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  49.54 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  49.2 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  50.16 
 
 		 318 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  49.52 
 
 		 318 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  51.67 
 
 		 319 aa  292  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  46.65 
 
 		 319 aa  291  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  49.84 
 
 		 335 aa  291  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  49.52 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  49.52 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  49.52 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  49.52 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  49.84 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  49.84 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  50.32 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  49.84 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.89 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  49.17 
 
 		 325 aa  285  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.59 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  51.27 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  51.14 
 
 		 324 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  48.44 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  49.84 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  50 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.08 
 
 		 318 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  48.59 
 
 		 325 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  46.43 
 
 		 329 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.56 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.98 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.75 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.67 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  43.65 
 
 		 320 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  47.33 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  50.94 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  45.97 
 
 		 328 aa  268  7e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  41.53 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.54 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  46 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  44.84 
 
 		 332 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.31 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.16 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.16 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  47.57 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  43.75 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  45.07 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.55 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  47.32 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.97 
 
 		 329 aa  262  8e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  44.78 
 
 		 333 aa  261  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  49.67 
 
 		 339 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  40.81 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  47 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.75 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.98 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  44.26 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  47.02 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  43.04 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  45.89 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  44.94 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  39.62 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  43.75 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>