More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2939 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
325 aa  658    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.16 
 
 
317 aa  524  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  70.62 
 
 
330 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.17 
 
 
331 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  58.17 
 
 
333 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.71 
 
 
342 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  58.22 
 
 
331 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.38 
 
 
333 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  57.19 
 
 
334 aa  363  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  54.95 
 
 
315 aa  361  8e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.03 
 
 
333 aa  359  3e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  54.05 
 
 
337 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  54.1 
 
 
337 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.04 
 
 
332 aa  345  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  52.41 
 
 
325 aa  344  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.41 
 
 
332 aa  344  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.58 
 
 
332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.06 
 
 
350 aa  342  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.93 
 
 
332 aa  341  8e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  53.7 
 
 
327 aa  341  9e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  51.25 
 
 
339 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.64 
 
 
350 aa  340  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  52.1 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  54.43 
 
 
332 aa  335  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.83 
 
 
354 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.34 
 
 
329 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  51.24 
 
 
335 aa  332  6e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.94 
 
 
318 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  52.94 
 
 
318 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
329 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  52.94 
 
 
318 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  52.94 
 
 
318 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  51.75 
 
 
328 aa  328  9e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.13 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  52.92 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  51.96 
 
 
316 aa  326  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.88 
 
 
329 aa  326  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.29 
 
 
327 aa  326  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  51.11 
 
 
318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 
432 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.44 
 
 
378 aa  323  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  51.8 
 
 
328 aa  323  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  52.12 
 
 
318 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  52.12 
 
 
318 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  52.12 
 
 
318 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  49.68 
 
 
345 aa  322  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  49.84 
 
 
323 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  51.66 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  49.06 
 
 
324 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  47.19 
 
 
370 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  52.44 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  50.49 
 
 
345 aa  319  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  51.79 
 
 
318 aa  318  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  48.71 
 
 
371 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  49.84 
 
 
318 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.1 
 
 
344 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 
353 aa  316  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  50 
 
 
318 aa  316  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  51.47 
 
 
318 aa  316  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  47.63 
 
 
347 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  48 
 
 
335 aa  314  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  50.63 
 
 
326 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  48.73 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.41 
 
 
318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  48.73 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  49.2 
 
 
340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  48.73 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  48.73 
 
 
377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  48.43 
 
 
321 aa  312  5.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  48.23 
 
 
320 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.31 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  50.81 
 
 
318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  48.26 
 
 
339 aa  309  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  49.83 
 
 
345 aa  309  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  51.16 
 
 
318 aa  309  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  48.09 
 
 
385 aa  309  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  48.41 
 
 
386 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  51.13 
 
 
319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  50.63 
 
 
331 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  48.54 
 
 
369 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  48.24 
 
 
318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.74 
 
 
336 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  48.29 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.3 
 
 
360 aa  302  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  49.52 
 
 
326 aa  302  5.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  50.32 
 
 
325 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  47.53 
 
 
348 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  47.25 
 
 
332 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  47.54 
 
 
318 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
346 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  46.13 
 
 
333 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  47.5 
 
 
327 aa  299  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.85 
 
 
396 aa  299  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  47.39 
 
 
334 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  46.42 
 
 
326 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  49.02 
 
 
318 aa  298  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  46.42 
 
 
326 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  48.86 
 
 
319 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  48.53 
 
 
319 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>