More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2145 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
346 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  89.36 
 
 
345 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  81.48 
 
 
360 aa  532  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.95 
 
 
432 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  74.63 
 
 
377 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  72.75 
 
 
390 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  72.75 
 
 
390 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  72.75 
 
 
390 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  72.67 
 
 
386 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  74.69 
 
 
385 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  76.97 
 
 
396 aa  494  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  73.35 
 
 
370 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  74.92 
 
 
371 aa  488  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.26 
 
 
362 aa  486  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.52 
 
 
378 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  67.57 
 
 
369 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  69.76 
 
 
400 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.31 
 
 
353 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  64.35 
 
 
369 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  67.41 
 
 
348 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  62.97 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  65.92 
 
 
346 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.03 
 
 
336 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  60.61 
 
 
339 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  57.51 
 
 
344 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.51 
 
 
350 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.72 
 
 
344 aa  368  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  56.39 
 
 
339 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  56.19 
 
 
337 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  56.11 
 
 
337 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.3 
 
 
354 aa  363  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  56.39 
 
 
345 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  54.91 
 
 
345 aa  352  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
342 aa  335  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  50.49 
 
 
327 aa  324  1e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  48.1 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  49.67 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  49.18 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  50.63 
 
 
324 aa  318  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.95 
 
 
331 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  47 
 
 
334 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  49.67 
 
 
331 aa  316  5e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
325 aa  315  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  46.37 
 
 
333 aa  315  7e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.2 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.23 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  50.48 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  50.98 
 
 
328 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.58 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.73 
 
 
333 aa  312  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  47.45 
 
 
340 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.16 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.83 
 
 
332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
329 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  49.83 
 
 
318 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  50.48 
 
 
335 aa  299  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  47.25 
 
 
320 aa  298  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.73 
 
 
317 aa  298  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  48.7 
 
 
318 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  48.87 
 
 
318 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  48.05 
 
 
318 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.87 
 
 
329 aa  295  7e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 
327 aa  295  7e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  48.38 
 
 
318 aa  295  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  47.5 
 
 
347 aa  295  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  47.94 
 
 
332 aa  295  9e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 
332 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
335 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.2 
 
 
332 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  48.38 
 
 
318 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  47.73 
 
 
318 aa  292  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  48.67 
 
 
326 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.51 
 
 
318 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  48.67 
 
 
326 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  47.4 
 
 
335 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  48.74 
 
 
319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  47.4 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.4 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  47.4 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  47.4 
 
 
318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  49.02 
 
 
331 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  48.74 
 
 
319 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  48.69 
 
 
331 aa  288  8e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  48.74 
 
 
319 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  49.51 
 
 
363 aa  288  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  46.89 
 
 
316 aa  288  8e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  46.75 
 
 
316 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  50 
 
 
319 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  48.74 
 
 
319 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  49.06 
 
 
319 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  48.74 
 
 
319 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  46.53 
 
 
323 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  49.34 
 
 
321 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  48.74 
 
 
319 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.85 
 
 
332 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2449  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.87 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281156  decreased coverage  0.00339489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  46.1 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  46.1 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  46.1 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>