More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4860 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  100 
 
 
329 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  100 
 
 
329 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  100 
 
 
329 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  86.02 
 
 
320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  87.03 
 
 
358 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  89.03 
 
 
320 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  83.44 
 
 
336 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  79.82 
 
 
340 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  77.67 
 
 
327 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  76.58 
 
 
342 aa  471  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.39 
 
 
320 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  77.24 
 
 
346 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  74.36 
 
 
353 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.79 
 
 
354 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  76.03 
 
 
327 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.97 
 
 
331 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  74.21 
 
 
355 aa  454  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3819  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.41 
 
 
332 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0427494  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.02 
 
 
327 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.29 
 
 
326 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  71.78 
 
 
342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0759  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  75.16 
 
 
351 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605957  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  67.17 
 
 
332 aa  421  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  63.75 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  58.82 
 
 
315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  57.65 
 
 
315 aa  352  7e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  55.56 
 
 
315 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  48.71 
 
 
340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 
310 aa  325  9e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  50.81 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.29 
 
 
318 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  46.56 
 
 
337 aa  315  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  45.51 
 
 
326 aa  315  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  53.31 
 
 
319 aa  315  9e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.8 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.03 
 
 
315 aa  312  5.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.29 
 
 
342 aa  311  6.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  50 
 
 
349 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  50.45 
 
 
346 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  51.21 
 
 
347 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.98 
 
 
318 aa  308  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.42 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 
326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  47.57 
 
 
313 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.28 
 
 
327 aa  305  8.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  51.96 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  50.33 
 
 
327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  55.15 
 
 
340 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.33 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.67 
 
 
318 aa  302  5.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  48.84 
 
 
314 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  50.78 
 
 
328 aa  301  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.7 
 
 
319 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.18 
 
 
325 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  53.4 
 
 
320 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.28 
 
 
331 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  44.74 
 
 
309 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  43.64 
 
 
328 aa  299  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  50.91 
 
 
335 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  44.87 
 
 
318 aa  299  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  51.12 
 
 
333 aa  298  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  42.72 
 
 
309 aa  298  7e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  51.91 
 
 
335 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  50.17 
 
 
317 aa  298  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  52.29 
 
 
320 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  45.39 
 
 
309 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.52 
 
 
387 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.8 
 
 
329 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
331 aa  296  4e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  48.79 
 
 
320 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  48.79 
 
 
320 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  48.79 
 
 
320 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  49.55 
 
 
320 aa  295  7e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  49.03 
 
 
325 aa  295  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
317 aa  295  9e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.71 
 
 
320 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.65 
 
 
320 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.71 
 
 
320 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  47.44 
 
 
320 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  47.3 
 
 
320 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46 
 
 
321 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.67 
 
 
317 aa  292  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  45.43 
 
 
325 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  44.98 
 
 
328 aa  292  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  50.71 
 
 
320 aa  292  6e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  44.09 
 
 
315 aa  291  7e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 
320 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.65 
 
 
320 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  45.65 
 
 
347 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  52.84 
 
 
325 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.05 
 
 
321 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  49.67 
 
 
323 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.29 
 
 
324 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.83 
 
 
321 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0408  ATPase  42.31 
 
 
310 aa  290  3e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00606389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  45.78 
 
 
312 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  50.18 
 
 
320 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.3 
 
 
350 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  46.93 
 
 
332 aa  288  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>