More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1835 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  100 
 
 		 315 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  88.25 
 
 		 315 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  73.02 
 
 		 315 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.16 
 
 		 315 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  57.52 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  58.82 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  58.82 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  58.82 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.14 
 
 		 342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  56.54 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  55.88 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.59 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  55.95 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  57.52 
 
 		 336 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.21 
 
 		 355 aa  341  9e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.46 
 
 		 331 aa  340  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.54 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  54.72 
 
 		 346 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3819  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.52 
 
 		 332 aa  335  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0427494  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  55.88 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.96 
 
 		 318 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  55.88 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  49.84 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  50.97 
 
 		 340 aa  326  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.92 
 
 		 354 aa  326  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.86 
 
 		 340 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.44 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.58 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.96 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  53.92 
 
 		 332 aa  319  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  48.23 
 
 		 337 aa  318  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  49.35 
 
 		 340 aa  316  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  49.02 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  50 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0759  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  53.27 
 
 		 351 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  49.68 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.29 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  48.7 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  50.49 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  50 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  50.63 
 
 		 325 aa  305  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  48.39 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 		 310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  49.03 
 
 		 333 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  48.3 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  48.06 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.4 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  47.74 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  49.2 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.78 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.25 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  48.87 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.08 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.19 
 
 		 342 aa  292  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.6 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.04 
 
 		 331 aa  291  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.23 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  47.95 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.4 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  48.09 
 
 		 316 aa  289  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  47.44 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.12 
 
 		 317 aa  288  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  45.25 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  49.2 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.37 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.25 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  46.56 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.3 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.05 
 
 		 321 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.42 
 
 		 350 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.89 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  47.57 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  46.54 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  45.16 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  47.1 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  46.42 
 
 		 337 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.96 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0253  ATPase  46.23 
 
 		 329 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.22 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  45.48 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  44.63 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  48.81 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  44.52 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  45.05 
 
 		 330 aa  278  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.66 
 
 		 318 aa  278  6e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.7 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.88 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0408  ATPase  45.78 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00606389  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  45.26 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.81 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  45.14 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0585  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.68 
 
 		 320 aa  277  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.44335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  45.54 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  46.54 
 
 		 317 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.92 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>