More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4025 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  93.43 
 
 		 349 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  100 
 
 		 346 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  86.63 
 
 		 333 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  80.06 
 
 		 347 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  79.48 
 
 		 335 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  79.77 
 
 		 335 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  80.38 
 
 		 328 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  57.89 
 
 		 325 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.28 
 
 		 328 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  44.66 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.7 
 
 		 319 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  50 
 
 		 315 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.47 
 
 		 331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.98 
 
 		 326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  50.98 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.95 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  52.72 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  48.68 
 
 		 319 aa  309  4e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  50.45 
 
 		 329 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  50.45 
 
 		 329 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  50.45 
 
 		 329 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  44.44 
 
 		 340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  48.4 
 
 		 315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.08 
 
 		 321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.13 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  43.04 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  48.05 
 
 		 316 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  48.41 
 
 		 340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.72 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.37 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  43.73 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.22 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  49.67 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  48.71 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.07 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 		 342 aa  298  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  49.67 
 
 		 342 aa  298  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.46 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  45.65 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  50.81 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  45.25 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  48.29 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  50.65 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.1 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 		 327 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.81 
 
 		 355 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  50.65 
 
 		 318 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  50.81 
 
 		 332 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.73 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.73 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 320 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  45.18 
 
 		 328 aa  292  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 		 331 aa  291  9e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  48.31 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  43.41 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  45.81 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.77 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  44.58 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  46.38 
 
 		 340 aa  290  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  49.84 
 
 		 320 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.57 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  46.62 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  45.32 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.13 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 		 308 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  45.69 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.53 
 
 		 329 aa  285  8e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  44.79 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  44.75 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  45.43 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  44.81 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.73 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  42.59 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.85 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  45.9 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.88 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.45 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.85 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.84 
 
 		 350 aa  281  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  45.94 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  43.87 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.2 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  45.37 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.41 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.5 
 
 		 320 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  44.1 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.84 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3819  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.92 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0427494  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  46.5 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.5 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  45.51 
 
 		 332 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  45.85 
 
 		 347 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  42.46 
 
 		 340 aa  279  4e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  47.28 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0759  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  49.19 
 
 		 351 aa  279  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  45.51 
 
 		 323 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  44.09 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  44.52 
 
 		 320 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>