More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0615 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
319 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.97 
 
 
328 aa  335  5e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  50 
 
 
340 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  48.74 
 
 
325 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  51.31 
 
 
315 aa  322  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  50.65 
 
 
335 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  50.65 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  50.32 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.05 
 
 
326 aa  319  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.87 
 
 
342 aa  318  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  49.03 
 
 
349 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  48.7 
 
 
346 aa  315  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  50.8 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  47.71 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  50.8 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  50.8 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  48.12 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.13 
 
 
331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  51.31 
 
 
353 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.87 
 
 
318 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 
326 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  49.35 
 
 
333 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.77 
 
 
329 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.42 
 
 
327 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  50.16 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  50.8 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  45.6 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  50 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.37 
 
 
318 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  48.21 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  49.36 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.48 
 
 
355 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  50.48 
 
 
358 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  47.32 
 
 
317 aa  300  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.77 
 
 
340 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  47.4 
 
 
315 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.42 
 
 
310 aa  299  3e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  49.66 
 
 
320 aa  298  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.03 
 
 
354 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.52 
 
 
325 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.33 
 
 
320 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  49.2 
 
 
342 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  51.45 
 
 
320 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.33 
 
 
320 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  48.84 
 
 
320 aa  295  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.69 
 
 
313 aa  295  6e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  45.54 
 
 
328 aa  295  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  46.53 
 
 
316 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.99 
 
 
320 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.89 
 
 
320 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.38 
 
 
321 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  48.84 
 
 
320 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.82 
 
 
320 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  50 
 
 
320 aa  292  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  50.33 
 
 
346 aa  292  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.1 
 
 
324 aa  291  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  48.18 
 
 
340 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3819  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.37 
 
 
332 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0427494  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  47.45 
 
 
327 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  49.84 
 
 
332 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.82 
 
 
342 aa  290  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  46.6 
 
 
314 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  49.18 
 
 
323 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  49.66 
 
 
324 aa  286  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  47.15 
 
 
327 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.86 
 
 
325 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  44.26 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.06 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.03 
 
 
325 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.89 
 
 
319 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.37 
 
 
313 aa  285  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  48.08 
 
 
337 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  48.43 
 
 
324 aa  285  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  46.18 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.63 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  46.98 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  46.98 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.22 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  48.56 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  48.03 
 
 
347 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.71 
 
 
350 aa  281  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.56 
 
 
318 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  49.22 
 
 
332 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.93 
 
 
321 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  46.43 
 
 
320 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  45.63 
 
 
317 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.63 
 
 
329 aa  280  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  47.56 
 
 
324 aa  280  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.5 
 
 
318 aa  280  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.68 
 
 
329 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.44 
 
 
333 aa  278  6e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.78 
 
 
343 aa  278  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.68 
 
 
329 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  45.02 
 
 
333 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  46.33 
 
 
345 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  46.63 
 
 
330 aa  278  1e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  46.58 
 
 
320 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  46.58 
 
 
320 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>