More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3819 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3819  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
332 aa  652    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0427494  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  79.87 
 
 
353 aa  505  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  78.41 
 
 
329 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  78.41 
 
 
329 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  78.41 
 
 
329 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  83.33 
 
 
355 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.23 
 
 
331 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  75.38 
 
 
336 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.74 
 
 
342 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  76.68 
 
 
354 aa  487  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.59 
 
 
320 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  75.24 
 
 
320 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  73.64 
 
 
358 aa  484  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  76.83 
 
 
327 aa  481  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  77.88 
 
 
346 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  72.06 
 
 
327 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.79 
 
 
327 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  77.56 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.81 
 
 
326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.53 
 
 
340 aa  461  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  75.56 
 
 
320 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0759  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  76.1 
 
 
351 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605957  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  73.57 
 
 
332 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  66.37 
 
 
340 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  55.52 
 
 
315 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  53.21 
 
 
315 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  53.42 
 
 
315 aa  342  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.91 
 
 
318 aa  322  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  50.66 
 
 
316 aa  321  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
318 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.4 
 
 
310 aa  318  7e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.81 
 
 
315 aa  317  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.37 
 
 
319 aa  312  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  43.99 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  49.84 
 
 
319 aa  305  6e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  47.92 
 
 
349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  51.79 
 
 
317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  53.11 
 
 
340 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  47.92 
 
 
346 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  52.43 
 
 
320 aa  302  7.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  45.02 
 
 
313 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  43.46 
 
 
326 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  47.71 
 
 
347 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
328 aa  299  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.3 
 
 
325 aa  299  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  51.47 
 
 
320 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  51.47 
 
 
320 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  51.47 
 
 
320 aa  299  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.46 
 
 
324 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  51.14 
 
 
320 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  47.11 
 
 
328 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  48.06 
 
 
335 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  48.01 
 
 
327 aa  296  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  41.67 
 
 
309 aa  295  5e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  52.12 
 
 
318 aa  295  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  51.14 
 
 
320 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.42 
 
 
320 aa  295  7e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  47.76 
 
 
335 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.7 
 
 
387 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0408  ATPase  40.76 
 
 
310 aa  293  3e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00606389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  45.48 
 
 
333 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.13 
 
 
342 aa  293  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  43.83 
 
 
308 aa  292  4e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  41.42 
 
 
337 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 
321 aa  292  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.94 
 
 
324 aa  292  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.47 
 
 
320 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.44 
 
 
313 aa  291  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.47 
 
 
320 aa  291  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.81 
 
 
320 aa  291  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.9 
 
 
319 aa  291  9e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  47.47 
 
 
320 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.81 
 
 
320 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  44.48 
 
 
320 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  44.16 
 
 
320 aa  289  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  43.17 
 
 
318 aa  289  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  48.75 
 
 
320 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  47.63 
 
 
324 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.94 
 
 
318 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  41.69 
 
 
309 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  40.72 
 
 
309 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  46.71 
 
 
310 aa  287  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.65 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.13 
 
 
313 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.34 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.12 
 
 
314 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  43.69 
 
 
347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  41.82 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  48.69 
 
 
318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  46.35 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  45.4 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.18 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  41.51 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  48.52 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.42 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.59 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.75 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.64 
 
 
325 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  43.79 
 
 
335 aa  280  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  48.52 
 
 
318 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>