More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0685 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
317 aa  618  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.43 
 
 
324 aa  431  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.09 
 
 
327 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.04 
 
 
324 aa  398  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  65.5 
 
 
335 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  66.01 
 
 
340 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  64.59 
 
 
332 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  69.74 
 
 
335 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  61.34 
 
 
325 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0902  ATPase  69.31 
 
 
335 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1589  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60 
 
 
341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0629676  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.6 
 
 
336 aa  353  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  59.8 
 
 
320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  59.8 
 
 
320 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  59.8 
 
 
320 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.5 
 
 
310 aa  342  5e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  59.15 
 
 
320 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  58.82 
 
 
317 aa  340  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  58.58 
 
 
320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1283  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.88 
 
 
324 aa  335  7e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000785499  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.6 
 
 
387 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  53.82 
 
 
319 aa  333  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
326 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.23 
 
 
327 aa  311  9e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.29 
 
 
318 aa  311  1e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.92 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  53.4 
 
 
318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  53.72 
 
 
318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2037  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.34 
 
 
316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.09 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.73 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.16 
 
 
315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.82 
 
 
319 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.15 
 
 
320 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.81 
 
 
320 aa  298  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  54.67 
 
 
329 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  54.67 
 
 
329 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  47.99 
 
 
320 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  54.67 
 
 
329 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.15 
 
 
320 aa  296  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  46.86 
 
 
320 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  48.43 
 
 
347 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  47.8 
 
 
323 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.15 
 
 
320 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.02 
 
 
318 aa  295  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.64 
 
 
322 aa  295  6e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1882  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.8 
 
 
321 aa  295  6e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.51 
 
 
308 aa  295  7e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  46.53 
 
 
320 aa  295  8e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.65 
 
 
321 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  54.88 
 
 
320 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  54.33 
 
 
336 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.5 
 
 
317 aa  291  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1090  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.29 
 
 
327 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.51 
 
 
322 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.27 
 
 
342 aa  289  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.21 
 
 
335 aa  289  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52 
 
 
309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  48.34 
 
 
313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  48.15 
 
 
320 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  54 
 
 
358 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.99 
 
 
326 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  54.48 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2110  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.91 
 
 
400 aa  285  5e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.625563  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  52.46 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.58 
 
 
403 aa  285  9e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  54.33 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  46.8 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  46.8 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  51.44 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  43.49 
 
 
314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.33 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.65 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.33 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  53.29 
 
 
346 aa  281  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0585  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.77 
 
 
320 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.44335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.9 
 
 
315 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0253  ATPase  44.2 
 
 
329 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.49 
 
 
313 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  53.09 
 
 
327 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  43.05 
 
 
318 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  47.32 
 
 
305 aa  280  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.46 
 
 
316 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.49 
 
 
331 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  45.69 
 
 
327 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  48.49 
 
 
310 aa  279  5e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.08 
 
 
340 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.97 
 
 
327 aa  278  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.22 
 
 
314 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 
306 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  51.83 
 
 
342 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  52.84 
 
 
316 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  47.39 
 
 
349 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  47.71 
 
 
346 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 
327 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0910  ATPase  45.78 
 
 
314 aa  276  3e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.81 
 
 
354 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.3 
 
 
313 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  43.19 
 
 
312 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.15 
 
 
325 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>