More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1054 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  100 
 
 
318 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.67 
 
 
321 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  60.84 
 
 
314 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  54.66 
 
 
323 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  57.05 
 
 
309 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.7 
 
 
319 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  53.7 
 
 
347 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.27 
 
 
325 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  51.77 
 
 
327 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  55.08 
 
 
312 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.08 
 
 
313 aa  363  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  55.12 
 
 
320 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  54.61 
 
 
320 aa  359  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  51.5 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.21 
 
 
314 aa  354  8.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  55.56 
 
 
320 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  55.63 
 
 
320 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  55.22 
 
 
320 aa  350  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
322 aa  350  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  54.39 
 
 
320 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  54.21 
 
 
320 aa  349  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.13 
 
 
318 aa  345  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  55.22 
 
 
320 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  51.82 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.95 
 
 
341 aa  338  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  48.42 
 
 
316 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  48.05 
 
 
350 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  51.22 
 
 
316 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.03 
 
 
354 aa  329  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 
313 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
324 aa  328  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.29 
 
 
314 aa  328  7e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.64 
 
 
319 aa  328  9e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.15 
 
 
315 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 
316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  52.86 
 
 
296 aa  326  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  52.86 
 
 
296 aa  326  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  47.21 
 
 
359 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  50 
 
 
326 aa  325  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  48.04 
 
 
309 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  47.02 
 
 
350 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.23 
 
 
337 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.68 
 
 
309 aa  322  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  47.21 
 
 
457 aa  318  6e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  46.82 
 
 
331 aa  318  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.73 
 
 
343 aa  318  9e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  48.03 
 
 
324 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  49.84 
 
 
308 aa  316  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  48.84 
 
 
310 aa  315  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.28 
 
 
330 aa  315  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  46.51 
 
 
331 aa  315  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  48.36 
 
 
319 aa  315  7e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  50.67 
 
 
310 aa  315  8e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  46.73 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.98 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  46.84 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.56 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  47.48 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  47.04 
 
 
331 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.19 
 
 
305 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  46.28 
 
 
340 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  48.31 
 
 
332 aa  311  9e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  48.03 
 
 
309 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  47.52 
 
 
309 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  47.19 
 
 
310 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  47.19 
 
 
310 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  48.36 
 
 
309 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  47.52 
 
 
310 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  48.05 
 
 
353 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  47.7 
 
 
309 aa  309  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  48.39 
 
 
325 aa  309  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.73 
 
 
336 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.23 
 
 
310 aa  309  4e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  47.19 
 
 
310 aa  309  5e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  47.7 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  47.7 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.95 
 
 
327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.17 
 
 
332 aa  308  6.999999999999999e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  47.52 
 
 
310 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  47.52 
 
 
310 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 
335 aa  308  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  48.03 
 
 
309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  46.71 
 
 
324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  46.58 
 
 
335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  47.7 
 
 
309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  46.86 
 
 
305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  44.59 
 
 
332 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  47.88 
 
 
342 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  47.7 
 
 
309 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.92 
 
 
327 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  47.85 
 
 
325 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  47.7 
 
 
309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.13 
 
 
354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  47.7 
 
 
309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.03 
 
 
326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 
339 aa  305  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.28 
 
 
325 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0902  ATPase  46.41 
 
 
335 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.3 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  47 
 
 
319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>