More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3910 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3910  ATPase  100 
 
 
332 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.8 
 
 
354 aa  484  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  74.77 
 
 
353 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  72.2 
 
 
331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.93 
 
 
327 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  72.45 
 
 
355 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  74.36 
 
 
342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  70.99 
 
 
327 aa  441  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.5 
 
 
342 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  70.93 
 
 
336 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  68.67 
 
 
329 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  68.67 
 
 
329 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  68.67 
 
 
329 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.35 
 
 
326 aa  431  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  72.12 
 
 
346 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.88 
 
 
320 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3819  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.57 
 
 
332 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0427494  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  68.04 
 
 
340 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  69.33 
 
 
320 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.97 
 
 
327 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  67.28 
 
 
358 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0759  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  71.11 
 
 
351 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605957  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.87 
 
 
340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  68.44 
 
 
320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  53.92 
 
 
315 aa  329  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  51.13 
 
 
315 aa  324  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  50.83 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  50.98 
 
 
315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.79 
 
 
310 aa  309  5e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  52.29 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.4 
 
 
324 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.77 
 
 
328 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  49.84 
 
 
349 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  50.16 
 
 
346 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.94 
 
 
318 aa  298  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
319 aa  296  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.27 
 
 
315 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  48.8 
 
 
328 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.31 
 
 
321 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.19 
 
 
325 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.62 
 
 
321 aa  295  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  47.21 
 
 
327 aa  295  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  47.59 
 
 
333 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  44.95 
 
 
347 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.05 
 
 
318 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  49.07 
 
 
347 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  45.78 
 
 
318 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  43.4 
 
 
326 aa  292  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  50.32 
 
 
320 aa  292  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  50.82 
 
 
317 aa  292  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  44.81 
 
 
312 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.14 
 
 
320 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  48.39 
 
 
323 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.14 
 
 
320 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.21 
 
 
308 aa  290  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  47.47 
 
 
320 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  51.47 
 
 
320 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  46.23 
 
 
320 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  48.65 
 
 
335 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  51.47 
 
 
320 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  51.47 
 
 
320 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  50.81 
 
 
335 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  50.49 
 
 
320 aa  289  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  45.45 
 
 
313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  49.68 
 
 
317 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.09 
 
 
324 aa  288  9e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  45.57 
 
 
320 aa  288  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  48.39 
 
 
320 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.13 
 
 
320 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0408  ATPase  41.46 
 
 
310 aa  288  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00606389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  47.63 
 
 
324 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  43.73 
 
 
337 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.13 
 
 
320 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
318 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  41.61 
 
 
330 aa  286  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.29 
 
 
387 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.32 
 
 
325 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  46.71 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  43.04 
 
 
340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.24 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  50.8 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  49.11 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.83 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  43.08 
 
 
315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.19 
 
 
336 aa  282  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  42.45 
 
 
328 aa  281  9e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  46.91 
 
 
325 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.02 
 
 
314 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.63 
 
 
319 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.56 
 
 
327 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.34 
 
 
342 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.34 
 
 
317 aa  280  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.4 
 
 
320 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.06 
 
 
325 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.25 
 
 
324 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.04 
 
 
305 aa  279  5e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  51.59 
 
 
318 aa  277  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>