More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1686 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
326 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.5 
 
 
325 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.39 
 
 
329 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  58.15 
 
 
337 aa  408  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  58.88 
 
 
340 aa  401  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  55.12 
 
 
326 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.05 
 
 
319 aa  319  5e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.53 
 
 
318 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  49.04 
 
 
320 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  49.04 
 
 
320 aa  316  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  49.53 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  49.52 
 
 
315 aa  308  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.45 
 
 
328 aa  308  9e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  46.13 
 
 
347 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  45.16 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.45 
 
 
320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.8 
 
 
320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  47.84 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  47.84 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  47.84 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  47.8 
 
 
320 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.8 
 
 
320 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  48.73 
 
 
327 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 
319 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.17 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  49.51 
 
 
316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  46.58 
 
 
323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  48.1 
 
 
324 aa  302  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  46.6 
 
 
335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  50 
 
 
320 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  46.6 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  45.79 
 
 
325 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.62 
 
 
326 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.33 
 
 
325 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.95 
 
 
327 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  45.03 
 
 
347 aa  299  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
340 aa  298  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  47.45 
 
 
336 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  46.39 
 
 
358 aa  297  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  49.04 
 
 
315 aa  296  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.13 
 
 
327 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  45.74 
 
 
328 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  46.38 
 
 
312 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  47.17 
 
 
320 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  47.1 
 
 
346 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  46.75 
 
 
314 aa  295  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.25 
 
 
327 aa  295  8e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  47.76 
 
 
327 aa  294  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.99 
 
 
333 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.52 
 
 
329 aa  293  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  48.08 
 
 
315 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.71 
 
 
350 aa  291  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  45.78 
 
 
349 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  47.1 
 
 
309 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  45.13 
 
 
333 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.36 
 
 
318 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.45 
 
 
354 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  44.55 
 
 
330 aa  289  3e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  46.77 
 
 
309 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.84 
 
 
333 aa  289  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  46.77 
 
 
309 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  46.05 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  46.45 
 
 
309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  43.67 
 
 
315 aa  289  6e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  46.77 
 
 
309 aa  288  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  46.77 
 
 
309 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.25 
 
 
331 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.12 
 
 
313 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  47.45 
 
 
346 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  45.81 
 
 
309 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  45.66 
 
 
309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  46.58 
 
 
320 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.34 
 
 
320 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.42 
 
 
327 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.23 
 
 
331 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  45.28 
 
 
296 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  45.28 
 
 
296 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  46.13 
 
 
309 aa  285  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  44.65 
 
 
347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.05 
 
 
318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.27 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.86 
 
 
342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.89 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  45.81 
 
 
309 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  44.9 
 
 
313 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.08 
 
 
319 aa  281  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.09 
 
 
318 aa  281  9e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  46.56 
 
 
316 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.05 
 
 
344 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.96 
 
 
349 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.09 
 
 
326 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  46.69 
 
 
325 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  44.09 
 
 
339 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  47.56 
 
 
350 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.55 
 
 
337 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  41.62 
 
 
330 aa  279  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  48.73 
 
 
372 aa  279  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  46.73 
 
 
340 aa  279  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 
309 aa  278  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>