More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3232 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3458  ATPase  93.14 
 
 
350 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  100 
 
 
350 aa  701    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.2 
 
 
335 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.57 
 
 
341 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  72.91 
 
 
326 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.11 
 
 
354 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  65.22 
 
 
359 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.16 
 
 
356 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  69.68 
 
 
325 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  64.83 
 
 
342 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.56 
 
 
330 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  69.36 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.72 
 
 
351 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  65.3 
 
 
324 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.71 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  66.44 
 
 
328 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  63.99 
 
 
372 aa  394  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.1 
 
 
332 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.9 
 
 
337 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.45 
 
 
326 aa  378  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  63.52 
 
 
342 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1280  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.55 
 
 
383 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000592788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  54.58 
 
 
314 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  53.92 
 
 
327 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  54.15 
 
 
347 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  54.17 
 
 
323 aa  347  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.77 
 
 
325 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.96 
 
 
313 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.27 
 
 
319 aa  338  8e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  52.24 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  49.52 
 
 
312 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  53.09 
 
 
331 aa  332  8e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  54.37 
 
 
324 aa  329  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49 
 
 
321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.18 
 
 
322 aa  326  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  52.77 
 
 
331 aa  325  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  54.37 
 
 
331 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  47.02 
 
 
318 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  49.68 
 
 
320 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  49.68 
 
 
320 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.64 
 
 
309 aa  322  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.97 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  49.35 
 
 
309 aa  320  3e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.77 
 
 
318 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2420  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.74 
 
 
325 aa  318  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.98 
 
 
315 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  50.51 
 
 
305 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  48.83 
 
 
310 aa  315  9e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  53.77 
 
 
325 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  50.68 
 
 
320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.68 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.68 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.02 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  50.81 
 
 
313 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.34 
 
 
320 aa  311  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.94 
 
 
324 aa  311  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  54.45 
 
 
316 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  49.49 
 
 
305 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.68 
 
 
320 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
313 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.13 
 
 
318 aa  305  9.000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51 
 
 
325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  47.77 
 
 
316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  50 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  51.25 
 
 
320 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  50 
 
 
310 aa  301  8.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.33 
 
 
319 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.46 
 
 
330 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  45.02 
 
 
318 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.7 
 
 
317 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16660  MoxR-like ATPase  54.72 
 
 
318 aa  297  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  47.44 
 
 
323 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 
343 aa  295  7e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  46.82 
 
 
322 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  47.96 
 
 
457 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  49.32 
 
 
296 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3212  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.7 
 
 
322 aa  293  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0307569  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  49.32 
 
 
296 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 
302 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  56.93 
 
 
319 aa  293  3e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.06 
 
 
323 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.96 
 
 
306 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.96 
 
 
306 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0485  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
327 aa  292  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.176782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  54.58 
 
 
352 aa  292  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2537  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 
320 aa  291  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  44.04 
 
 
340 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.68 
 
 
302 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.09 
 
 
314 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  47.83 
 
 
319 aa  289  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.67 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  44.85 
 
 
308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 
329 aa  289  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  41.46 
 
 
326 aa  289  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  46.77 
 
 
319 aa  288  7e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.71 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  47.68 
 
 
310 aa  285  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.9 
 
 
312 aa  285  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.85 
 
 
336 aa  285  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>