More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0253 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0253  ATPase  100 
 
 		 329 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.79 
 
 		 310 aa  360  1e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0910  ATPase  53.55 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  52.44 
 
 		 302 aa  333  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  51.27 
 
 		 319 aa  332  5e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  55 
 
 		 302 aa  318  1e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  53.68 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  53.33 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  52.41 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  49.53 
 
 		 320 aa  309  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  52.98 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  52.98 
 
 		 320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  49.22 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  49.68 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  48.59 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  48.59 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  53.6 
 
 		 320 aa  305  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  49.36 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  48.08 
 
 		 317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.85 
 
 		 313 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  48.43 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  47.65 
 
 		 325 aa  301  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  52.88 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.96 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  51.6 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.03 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.34 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  46.05 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.03 
 
 		 324 aa  295  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.68 
 
 		 387 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  48.38 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0902  ATPase  50.94 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.89 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  44.76 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.4 
 
 		 322 aa  292  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2110  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 		 400 aa  291  7e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.625563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  47.23 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  46.84 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  50.32 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  46.77 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.69 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.51 
 
 		 316 aa  289  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  51.23 
 
 		 296 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  51.23 
 
 		 296 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.41 
 
 		 312 aa  288  7e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.6 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  47.25 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  46.18 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  45.4 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.47 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.63 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1942  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.67 
 
 		 322 aa  285  7e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  46.18 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.67 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  44.69 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.79 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  47.21 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  46.23 
 
 		 315 aa  281  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  44.87 
 
 		 340 aa  281  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.56 
 
 		 324 aa  281  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1589  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 		 341 aa  281  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0629676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.1 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2957  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.05 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  45.4 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.93 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2421  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.1 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.13 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  48.52 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  49.44 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.81 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  48.52 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  46.23 
 
 		 309 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  48.52 
 
 		 329 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  47.85 
 
 		 320 aa  279  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2037  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.98 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.3 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.13 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  47.19 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.67 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  43.85 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.89 
 
 		 351 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  46.23 
 
 		 350 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.09 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.95 
 
 		 314 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.11 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  43.77 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.25 
 
 		 329 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.02 
 
 		 318 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.94 
 
 		 317 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  45.62 
 
 		 353 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.77 
 
 		 403 aa  275  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  44.22 
 
 		 337 aa  275  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  44.34 
 
 		 325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18600  MoxR-like ATPase  47.06 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191863  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.45 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  47.6 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>