More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4071 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  100 
 
 		 331 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  81.79 
 
 		 324 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.34 
 
 		 327 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  52.16 
 
 		 327 aa  325  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  54.37 
 
 		 350 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.66 
 
 		 354 aa  322  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.82 
 
 		 341 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  50.46 
 
 		 359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  52.75 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  52.49 
 
 		 347 aa  319  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.66 
 
 		 319 aa  318  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.83 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  50.77 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.15 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  47.08 
 
 		 312 aa  315  7e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  48.51 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  47.04 
 
 		 318 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  51.34 
 
 		 313 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  50.97 
 
 		 323 aa  311  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  52.27 
 
 		 325 aa  311  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  50.32 
 
 		 323 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  51.75 
 
 		 331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.69 
 
 		 337 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  46.82 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  52.06 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  46.82 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.27 
 
 		 318 aa  305  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.36 
 
 		 323 aa  305  9.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  52.19 
 
 		 326 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.25 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0485  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.62 
 
 		 327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.176782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.5 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 		 322 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.83 
 
 		 351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  49.52 
 
 		 322 aa  302  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 		 335 aa  302  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.95 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  52.4 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.35 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.4 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  48.7 
 
 		 457 aa  299  5e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  52.63 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.51 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.32 
 
 		 319 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.97 
 
 		 320 aa  295  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.64 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.82 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.3 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.89 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.97 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.67 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  46.64 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  51.76 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  48.59 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  46.98 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  47.62 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  52.81 
 
 		 318 aa  288  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  48.31 
 
 		 320 aa  288  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  53.9 
 
 		 342 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  50.83 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  48.32 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.33 
 
 		 308 aa  285  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  51.59 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  44.12 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.09 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  45.3 
 
 		 309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.27 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.36 
 
 		 309 aa  282  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  47.11 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  44.97 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  52.3 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  43.93 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  43.93 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  43.93 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  43.79 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  46.95 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  43.46 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.21 
 
 		 327 aa  279  6e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  43.46 
 
 		 310 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  43.97 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  43.28 
 
 		 310 aa  278  9e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.18 
 
 		 326 aa  278  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  47.59 
 
 		 372 aa  278  9e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2912  ATPase  52.32 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.29 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.29 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  46.96 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  44.19 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.81 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  46.96 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.84 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.22 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0902  ATPase  51.32 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  45.81 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  47.14 
 
 		 319 aa  275  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>