More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5108 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  100 
 
 
342 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  78.65 
 
 
342 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.96 
 
 
354 aa  414  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.81 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  65.18 
 
 
326 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  64.83 
 
 
350 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  65.22 
 
 
350 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.49 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  65.72 
 
 
325 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  63.12 
 
 
359 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  68.77 
 
 
324 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  69.23 
 
 
332 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  63.64 
 
 
328 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.82 
 
 
356 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.76 
 
 
335 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.07 
 
 
339 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.69 
 
 
351 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  57.1 
 
 
372 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.63 
 
 
337 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.06 
 
 
332 aa  361  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1280  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.25 
 
 
383 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000592788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.32 
 
 
326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  53.04 
 
 
323 aa  328  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  54.39 
 
 
314 aa  326  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  52.31 
 
 
347 aa  324  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.52 
 
 
319 aa  323  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.4 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  48.17 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  49.84 
 
 
320 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.11 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2420  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.25 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
314 aa  318  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  49.51 
 
 
320 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  48.85 
 
 
312 aa  315  7e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  52.56 
 
 
352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  54.21 
 
 
324 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 
313 aa  311  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  49.52 
 
 
331 aa  311  9e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.48 
 
 
322 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  45.74 
 
 
318 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  52.33 
 
 
317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.11 
 
 
315 aa  309  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  48.91 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.8 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  51.41 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.41 
 
 
320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.06 
 
 
320 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.7 
 
 
320 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  48.41 
 
 
318 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  52.88 
 
 
319 aa  299  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  46.43 
 
 
309 aa  299  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  49.32 
 
 
305 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.35 
 
 
320 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  50.47 
 
 
325 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  50.17 
 
 
313 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  52.63 
 
 
331 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  54.14 
 
 
316 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16660  MoxR-like ATPase  55.29 
 
 
318 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.15 
 
 
321 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 
309 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  48.31 
 
 
305 aa  295  7e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  50.16 
 
 
331 aa  295  8e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3212  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.52 
 
 
322 aa  294  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0307569  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.32 
 
 
313 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  51.67 
 
 
320 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.69 
 
 
306 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.14 
 
 
327 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.02 
 
 
310 aa  290  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.31 
 
 
330 aa  289  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
312 aa  288  7e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.24 
 
 
306 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.24 
 
 
306 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.34 
 
 
343 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1288  ATPase  47.1 
 
 
323 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
324 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  51.24 
 
 
316 aa  286  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.08 
 
 
314 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  46.2 
 
 
322 aa  285  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2537  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.76 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.36 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  46.9 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  50.89 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.56 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.99 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  44.88 
 
 
308 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.64 
 
 
325 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1332  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.39 
 
 
323 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.25 
 
 
317 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.05 
 
 
316 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  46.3 
 
 
457 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.18 
 
 
324 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.02 
 
 
319 aa  279  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  49.3 
 
 
296 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  49.3 
 
 
296 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0485  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.02 
 
 
327 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.176782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  47.35 
 
 
319 aa  276  3e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  46.82 
 
 
302 aa  276  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  42.17 
 
 
326 aa  275  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.34 
 
 
325 aa  275  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>