More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0369 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  100 
 
 
336 aa  665    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  71.6 
 
 
349 aa  461  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.06 
 
 
336 aa  441  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  68.09 
 
 
336 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.09 
 
 
336 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.66 
 
 
336 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  69.61 
 
 
333 aa  434  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  66.47 
 
 
336 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  64.9 
 
 
337 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.19 
 
 
333 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.27 
 
 
334 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  65.85 
 
 
334 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  65.94 
 
 
332 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  66.46 
 
 
333 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  62.05 
 
 
335 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.35 
 
 
350 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  65.36 
 
 
332 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  65.15 
 
 
346 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  63.83 
 
 
340 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  62.05 
 
 
335 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  65.38 
 
 
337 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  61.75 
 
 
335 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  64.16 
 
 
334 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  66.87 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  64.98 
 
 
335 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  66.56 
 
 
335 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  65.81 
 
 
342 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  63.78 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.59 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  63.66 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.59 
 
 
336 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  56.47 
 
 
343 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  62.73 
 
 
338 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  64.2 
 
 
333 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  62.73 
 
 
338 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  62.7 
 
 
362 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  66.67 
 
 
335 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.92 
 
 
327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  47.35 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  47.98 
 
 
317 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.33 
 
 
308 aa  322  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.55 
 
 
327 aa  322  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.44 
 
 
379 aa  322  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.2 
 
 
356 aa  320  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.02 
 
 
320 aa  320  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  50.15 
 
 
338 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.77 
 
 
351 aa  315  6e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  50.3 
 
 
343 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.61 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  49.53 
 
 
356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.3 
 
 
341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.34 
 
 
320 aa  309  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.62 
 
 
334 aa  306  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  45.37 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.42 
 
 
349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.53 
 
 
333 aa  302  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.79 
 
 
338 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.59 
 
 
334 aa  299  5e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.41 
 
 
345 aa  295  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  49.01 
 
 
334 aa  295  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  49.02 
 
 
329 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  46.6 
 
 
334 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  44.83 
 
 
324 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.93 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 
341 aa  282  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.63 
 
 
325 aa  275  8e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.6 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.65 
 
 
313 aa  272  7e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  43.89 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  44.48 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  47.23 
 
 
320 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.1 
 
 
333 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  42.9 
 
 
324 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  40.86 
 
 
339 aa  259  6e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  41.56 
 
 
332 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.04 
 
 
341 aa  257  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  45.63 
 
 
319 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  47.12 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  46.47 
 
 
319 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  46.47 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  46.47 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  46.63 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  43.81 
 
 
326 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  45.93 
 
 
333 aa  252  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  46.56 
 
 
326 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  45.19 
 
 
319 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  45.83 
 
 
319 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  45.19 
 
 
319 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  46.56 
 
 
326 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.29 
 
 
331 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  39.88 
 
 
331 aa  250  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  45.93 
 
 
333 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  45.93 
 
 
333 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.2 
 
 
432 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.12 
 
 
350 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  44.65 
 
 
337 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  43.67 
 
 
324 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  38.51 
 
 
329 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  40.53 
 
 
340 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.94 
 
 
329 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>