More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0190 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  100 
 
 		 321 aa  661    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.73 
 
 		 320 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.97 
 
 		 308 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  64.87 
 
 		 317 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.17 
 
 		 320 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  64.56 
 
 		 317 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.68 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  55.45 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  54.97 
 
 		 338 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.59 
 
 		 341 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.59 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.49 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.62 
 
 		 345 aa  348  5e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.78 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.31 
 
 		 351 aa  341  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.33 
 
 		 349 aa  339  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.45 
 
 		 338 aa  338  8e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.96 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  54.11 
 
 		 343 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  52.82 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  50 
 
 		 342 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  52.49 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 		 327 aa  326  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  52.49 
 
 		 335 aa  325  9e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  53.14 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  52.33 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  50.78 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  51.49 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.58 
 
 		 334 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  51.49 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  51.58 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  49.85 
 
 		 334 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  53 
 
 		 333 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  51.27 
 
 		 334 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.49 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.36 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  50.63 
 
 		 337 aa  315  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  50.32 
 
 		 332 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  50.95 
 
 		 332 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  50.65 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  48.46 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.17 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  49.36 
 
 		 324 aa  312  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  50.16 
 
 		 336 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 		 336 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.18 
 
 		 336 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  50 
 
 		 335 aa  308  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.63 
 
 		 336 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  51 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  48.34 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  50.5 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.16 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  49.07 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  49.07 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  48.69 
 
 		 333 aa  305  8.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  49.03 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  47.08 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  45.37 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  49.38 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.66 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  47.77 
 
 		 338 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.09 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  46.25 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.26 
 
 		 350 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.66 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  49.67 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  50.16 
 
 		 334 aa  295  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  49.51 
 
 		 318 aa  295  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  46.6 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  49.16 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.71 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.67 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  46 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.54 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  45.72 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  45.66 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.96 
 
 		 350 aa  275  7e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  45.07 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.13 
 
 		 354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  44.74 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  47.02 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.39 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  42.11 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  43.45 
 
 		 344 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  44.52 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  44.48 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  45.21 
 
 		 337 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  42.72 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  44.37 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  45.34 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.26 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.97 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.62 
 
 		 319 aa  268  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.37 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>