More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1376 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 334 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  93.71 
 
 		 334 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  93.66 
 
 		 332 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  89.52 
 
 		 334 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  90.94 
 
 		 332 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  89.63 
 
 		 346 aa  594  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  88.13 
 
 		 337 aa  591  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  76.05 
 
 		 333 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  73.62 
 
 		 333 aa  488  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.38 
 
 		 333 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  71.78 
 
 		 336 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  68.67 
 
 		 336 aa  461  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.67 
 
 		 336 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.67 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.43 
 
 		 336 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  69.16 
 
 		 349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  69.91 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  68.67 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  68.67 
 
 		 335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  68.35 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  69.97 
 
 		 334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.77 
 
 		 336 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.14 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  66.77 
 
 		 340 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  69.06 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  66.27 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  63.17 
 
 		 343 aa  428  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  65.03 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  65.03 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  62.5 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  61.25 
 
 		 332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  62.81 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.02 
 
 		 350 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  61.61 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  63.16 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  62.34 
 
 		 362 aa  374  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  64.03 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.47 
 
 		 320 aa  325  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  51.58 
 
 		 321 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.83 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  50.5 
 
 		 317 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  50.5 
 
 		 317 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.15 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.15 
 
 		 379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.09 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.5 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.42 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  49.84 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.18 
 
 		 334 aa  291  8e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.23 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  47.44 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  48.84 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  45.06 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.18 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.93 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.56 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  46.84 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.73 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.33 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  43.75 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  46.67 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  45.37 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.72 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.47 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.95 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  45.7 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  45.31 
 
 		 318 aa  262  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  41.95 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.67 
 
 		 333 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  42.77 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.52 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  40.13 
 
 		 315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  41.19 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  43.85 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  43.99 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  44.14 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  44.19 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  43.67 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  42.9 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  44.22 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  43.42 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  43.67 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  41.14 
 
 		 332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.72 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  43.14 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  43.14 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  43.31 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  44.16 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  40.48 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.84 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.65 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  42.44 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  43.93 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  39.43 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.74 
 
 		 329 aa  235  8e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>