More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2774 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
351 aa  713    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.6 
 
 
345 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.31 
 
 
334 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.89 
 
 
320 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.6 
 
 
349 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  52.34 
 
 
317 aa  361  9e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  54.15 
 
 
338 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.84 
 
 
308 aa  360  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.94 
 
 
356 aa  359  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  52.34 
 
 
317 aa  358  9e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  53.56 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.18 
 
 
334 aa  357  9.999999999999999e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.87 
 
 
341 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  53.33 
 
 
356 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.93 
 
 
327 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.56 
 
 
341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.08 
 
 
379 aa  354  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.21 
 
 
338 aa  348  6e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.09 
 
 
320 aa  348  8e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.46 
 
 
327 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  50.31 
 
 
321 aa  341  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  47.75 
 
 
324 aa  323  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  50.8 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  50.16 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 
333 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  49.69 
 
 
334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  50.77 
 
 
336 aa  315  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.88 
 
 
325 aa  315  7e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  47.26 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  46.81 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
341 aa  312  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.15 
 
 
313 aa  309  5e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.46 
 
 
336 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  51.13 
 
 
342 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  50.48 
 
 
332 aa  308  8e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.99 
 
 
334 aa  308  9e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  50.49 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  47.12 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  49.24 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  51.31 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  50.98 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.13 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  51.13 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  50.98 
 
 
335 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  48.14 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  48.24 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  48.45 
 
 
337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  47.72 
 
 
332 aa  302  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
350 aa  302  7.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  50.65 
 
 
333 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  51.11 
 
 
333 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  48.77 
 
 
349 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  51.18 
 
 
335 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  50.81 
 
 
334 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  45.54 
 
 
339 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
334 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.98 
 
 
333 aa  299  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  48.46 
 
 
346 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
336 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  49.2 
 
 
334 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  48.28 
 
 
328 aa  296  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  49.52 
 
 
332 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.44 
 
 
336 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  48.04 
 
 
333 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  48.44 
 
 
336 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  49.69 
 
 
336 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  50.79 
 
 
338 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.27 
 
 
325 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  50.79 
 
 
338 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  51.52 
 
 
338 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.12 
 
 
336 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  44 
 
 
325 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  47.65 
 
 
335 aa  292  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.27 
 
 
344 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.99 
 
 
329 aa  288  9e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  49.84 
 
 
332 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  45.12 
 
 
327 aa  286  4e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  47.02 
 
 
333 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  50.31 
 
 
334 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.03 
 
 
331 aa  285  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  45.79 
 
 
337 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  46.62 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  47.35 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  45.19 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  49.68 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  48.08 
 
 
324 aa  282  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.54 
 
 
350 aa  282  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  46.46 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  43.07 
 
 
331 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  47.04 
 
 
344 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.77 
 
 
354 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  47.84 
 
 
347 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  47.42 
 
 
362 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.53 
 
 
350 aa  279  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  47.84 
 
 
335 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  49.19 
 
 
371 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  47.53 
 
 
335 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  44.09 
 
 
332 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  46.37 
 
 
337 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>