More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0805 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
320 aa  657    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  80.84 
 
 
308 aa  530  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  73.73 
 
 
321 aa  485  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.08 
 
 
320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  67.41 
 
 
317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  65.19 
 
 
317 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.68 
 
 
334 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.63 
 
 
341 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.63 
 
 
341 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  56.7 
 
 
343 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  55.76 
 
 
338 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.32 
 
 
379 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.37 
 
 
334 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53 
 
 
349 aa  353  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.86 
 
 
327 aa  352  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.09 
 
 
351 aa  348  7e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.17 
 
 
345 aa  347  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.7 
 
 
356 aa  343  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  53.46 
 
 
338 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  53.44 
 
 
343 aa  337  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  53.46 
 
 
338 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.44 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  53.77 
 
 
338 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  51.89 
 
 
340 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  51.25 
 
 
349 aa  331  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  51.26 
 
 
342 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.89 
 
 
336 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  50 
 
 
335 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.94 
 
 
336 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  51.74 
 
 
336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  50.79 
 
 
332 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.74 
 
 
336 aa  325  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  52.48 
 
 
333 aa  325  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  49.37 
 
 
335 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.47 
 
 
334 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  49.06 
 
 
335 aa  322  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.29 
 
 
325 aa  322  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  50.79 
 
 
334 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  47.72 
 
 
356 aa  321  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  49.84 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.79 
 
 
336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  50.79 
 
 
336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  50.16 
 
 
332 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 
333 aa  318  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  50.96 
 
 
335 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  49.21 
 
 
346 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  317  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  51.48 
 
 
337 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  49.84 
 
 
333 aa  316  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  49.38 
 
 
332 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  50 
 
 
324 aa  315  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.47 
 
 
336 aa  315  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  48.9 
 
 
337 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  49.51 
 
 
334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.88 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.5 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  46.98 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 
350 aa  312  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.36 
 
 
325 aa  312  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  47.65 
 
 
334 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  47.34 
 
 
336 aa  309  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.56 
 
 
333 aa  305  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  49.36 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  47.88 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  47.56 
 
 
324 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  51.49 
 
 
362 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
313 aa  300  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  48.51 
 
 
328 aa  298  6e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  49.84 
 
 
334 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.03 
 
 
334 aa  293  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.2 
 
 
329 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  46.5 
 
 
339 aa  292  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  49.84 
 
 
318 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  44.98 
 
 
315 aa  290  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.23 
 
 
350 aa  286  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.57 
 
 
331 aa  285  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  47.1 
 
 
349 aa  285  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  49.34 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  50.65 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  48.08 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  46.45 
 
 
346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  47.18 
 
 
330 aa  282  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  48.5 
 
 
332 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.72 
 
 
329 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.51 
 
 
325 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.16 
 
 
332 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  46.91 
 
 
330 aa  275  7e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.56 
 
 
332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 
354 aa  272  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 
317 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  43.57 
 
 
325 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  46.71 
 
 
332 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.69 
 
 
337 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.7 
 
 
333 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  45.16 
 
 
333 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.25 
 
 
332 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  44.77 
 
 
337 aa  268  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.76 
 
 
318 aa  268  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  46.49 
 
 
339 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>