More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0488 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
320 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.08 
 
 
320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.43 
 
 
308 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  64.56 
 
 
317 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  63.81 
 
 
317 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  63.17 
 
 
321 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.1 
 
 
334 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  54.52 
 
 
343 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.89 
 
 
351 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.18 
 
 
341 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  54.21 
 
 
338 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.89 
 
 
341 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.58 
 
 
334 aa  370  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.78 
 
 
345 aa  363  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.06 
 
 
379 aa  358  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.27 
 
 
349 aa  354  8.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.29 
 
 
338 aa  343  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.79 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.25 
 
 
327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  49.67 
 
 
356 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  48.45 
 
 
342 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.3 
 
 
327 aa  328  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  50.99 
 
 
337 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  49.84 
 
 
335 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  49.84 
 
 
335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  48.9 
 
 
343 aa  325  5e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  47.32 
 
 
349 aa  325  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  48.26 
 
 
337 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  49.84 
 
 
335 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.34 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  50.5 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.68 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  47.02 
 
 
336 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  50.33 
 
 
334 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  48.85 
 
 
340 aa  319  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  47.19 
 
 
332 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  47.63 
 
 
346 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  47.63 
 
 
334 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47 
 
 
334 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.01 
 
 
350 aa  315  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  47 
 
 
332 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.69 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  45.94 
 
 
333 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.69 
 
 
333 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  47.19 
 
 
336 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.5 
 
 
336 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  44.27 
 
 
329 aa  309  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.69 
 
 
325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  45.45 
 
 
334 aa  308  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.88 
 
 
336 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  47 
 
 
332 aa  308  8e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  46.88 
 
 
336 aa  308  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  45.03 
 
 
334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.56 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.86 
 
 
333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.09 
 
 
325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.22 
 
 
341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  46.5 
 
 
324 aa  306  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  45.31 
 
 
335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  47.19 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  45.74 
 
 
335 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.68 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  46.15 
 
 
324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  46.37 
 
 
338 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  46.37 
 
 
338 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  46.86 
 
 
362 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  45.74 
 
 
338 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  46.86 
 
 
333 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  48.17 
 
 
328 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.42 
 
 
334 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.68 
 
 
329 aa  285  9e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  46.89 
 
 
330 aa  285  9e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.48 
 
 
329 aa  280  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  47.49 
 
 
332 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  46.36 
 
 
328 aa  276  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  44.9 
 
 
349 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  43.79 
 
 
346 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  45.42 
 
 
339 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.63 
 
 
350 aa  276  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  45.02 
 
 
345 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 
331 aa  275  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.04 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  45.3 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  44.88 
 
 
315 aa  273  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  44.44 
 
 
318 aa  272  7e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  45.1 
 
 
344 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  47.83 
 
 
330 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  43.48 
 
 
337 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.74 
 
 
332 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.4 
 
 
326 aa  268  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  43.09 
 
 
324 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  45.22 
 
 
328 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.44 
 
 
350 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.45 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.63 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  46.56 
 
 
326 aa  266  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.15 
 
 
317 aa  265  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  45.98 
 
 
347 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.17 
 
 
318 aa  265  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  45.02 
 
 
335 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>