More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0203 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  95.86 
 
 
338 aa  641    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  100 
 
 
338 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  95.86 
 
 
338 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  75.23 
 
 
335 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  75.45 
 
 
335 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  71.43 
 
 
333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  75.47 
 
 
335 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.31 
 
 
336 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  66.25 
 
 
336 aa  411  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.5 
 
 
334 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  63.35 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  62.81 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.46 
 
 
333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  63.12 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.35 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  62.8 
 
 
349 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.73 
 
 
336 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  63.55 
 
 
333 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  61.25 
 
 
334 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  61.99 
 
 
332 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  63.66 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  60.62 
 
 
346 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  63.47 
 
 
332 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  61.92 
 
 
335 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  62.23 
 
 
335 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  61.92 
 
 
335 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  60.94 
 
 
337 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  65.15 
 
 
333 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  62.89 
 
 
342 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  63.58 
 
 
337 aa  384  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.99 
 
 
350 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.24 
 
 
336 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.63 
 
 
336 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  62.94 
 
 
362 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  62.5 
 
 
340 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  56.62 
 
 
343 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  62.19 
 
 
334 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.77 
 
 
320 aa  335  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  49.84 
 
 
317 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.95 
 
 
308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  47.38 
 
 
317 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  52.92 
 
 
338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.86 
 
 
379 aa  302  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.97 
 
 
334 aa  301  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  47.77 
 
 
321 aa  301  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.44 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.6 
 
 
341 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.82 
 
 
341 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  47.47 
 
 
356 aa  299  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  51.82 
 
 
343 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.24 
 
 
349 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.74 
 
 
320 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.52 
 
 
351 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 
334 aa  293  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.08 
 
 
327 aa  291  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.39 
 
 
356 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.7 
 
 
338 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.86 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.21 
 
 
313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  46.18 
 
 
324 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  46.46 
 
 
324 aa  271  9e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  45.7 
 
 
324 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  41.53 
 
 
339 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.77 
 
 
345 aa  264  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.89 
 
 
334 aa  259  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.16 
 
 
325 aa  258  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.03 
 
 
341 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.53 
 
 
333 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  44.22 
 
 
318 aa  255  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.04 
 
 
333 aa  255  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  43.32 
 
 
329 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  44.74 
 
 
334 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.18 
 
 
331 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  43.1 
 
 
340 aa  249  7e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  42.9 
 
 
320 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  44.41 
 
 
334 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.22 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  40.31 
 
 
331 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  40.71 
 
 
315 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  40.54 
 
 
340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  45.28 
 
 
353 aa  238  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.45 
 
 
354 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.27 
 
 
310 aa  237  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  42.36 
 
 
332 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  43.95 
 
 
329 aa  236  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.53 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.16 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.37 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  42.55 
 
 
326 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  41.38 
 
 
325 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  46.28 
 
 
320 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  38.39 
 
 
328 aa  233  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.79 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  45.69 
 
 
346 aa  231  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  43.65 
 
 
332 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.22 
 
 
350 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.08 
 
 
325 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  45.31 
 
 
325 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.72 
 
 
325 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  43.26 
 
 
337 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>