More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3277 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  100 
 
 
310 aa  634    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.44 
 
 
305 aa  421  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.14 
 
 
305 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  57.34 
 
 
305 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  54.22 
 
 
312 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1632  MoxR family protein  56.46 
 
 
313 aa  342  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000221226  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1696  MoxR family protein  55.44 
 
 
313 aa  341  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  49.02 
 
 
314 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  54.64 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.65 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  49.3 
 
 
306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  51.83 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  45.78 
 
 
306 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  48.24 
 
 
306 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  51.16 
 
 
305 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  45.13 
 
 
306 aa  299  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  50.83 
 
 
305 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.31 
 
 
325 aa  298  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  48.15 
 
 
347 aa  297  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  46.95 
 
 
323 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 
306 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  50.54 
 
 
315 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.51 
 
 
314 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  49.17 
 
 
306 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  53.33 
 
 
303 aa  294  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  46.86 
 
 
305 aa  293  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  50.53 
 
 
303 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  51.11 
 
 
315 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  48.34 
 
 
303 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  50.33 
 
 
305 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  49.67 
 
 
305 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  50.53 
 
 
303 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  48.24 
 
 
306 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.42 
 
 
331 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  50.18 
 
 
303 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  51.42 
 
 
303 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  51.8 
 
 
303 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  49.83 
 
 
309 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  49.31 
 
 
303 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.62 
 
 
322 aa  289  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  48.68 
 
 
303 aa  288  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  47.1 
 
 
308 aa  288  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  44.44 
 
 
312 aa  288  7e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.78 
 
 
306 aa  288  8e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  45.78 
 
 
306 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.09 
 
 
321 aa  288  9e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  44.16 
 
 
306 aa  288  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  45.67 
 
 
319 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  52.65 
 
 
303 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  48.11 
 
 
327 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  52.65 
 
 
313 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.02 
 
 
310 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  52.65 
 
 
303 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.09 
 
 
313 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  52.27 
 
 
303 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  45.54 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  45.02 
 
 
310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  50.68 
 
 
315 aa  286  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  51.52 
 
 
303 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  51.52 
 
 
303 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.52 
 
 
303 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0240  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.98 
 
 
303 aa  285  9e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.288695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.47 
 
 
325 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.92 
 
 
317 aa  282  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.2 
 
 
315 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 
319 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
333 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  50 
 
 
305 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  45.57 
 
 
302 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  41.99 
 
 
318 aa  278  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  48.03 
 
 
321 aa  278  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  46.94 
 
 
304 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  48.1 
 
 
303 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  46.2 
 
 
349 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  49.82 
 
 
310 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  45.36 
 
 
317 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.1 
 
 
300 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  46.6 
 
 
304 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4605  ATPase  45.73 
 
 
323 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.66 
 
 
318 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.95 
 
 
310 aa  276  4e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.42 
 
 
330 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  45.36 
 
 
317 aa  275  6e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  42.07 
 
 
314 aa  275  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.82 
 
 
309 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.57 
 
 
327 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  45.73 
 
 
332 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.09 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  48.41 
 
 
335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  48.63 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  47.46 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  48.06 
 
 
335 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.33 
 
 
323 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  50.17 
 
 
315 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.76 
 
 
318 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.33 
 
 
323 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.75 
 
 
337 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  48.73 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  47.46 
 
 
305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  45.34 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>