70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1403 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  90.24 
 
 		 369 aa  685    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  89.7 
 
 		 369 aa  678    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  83.47 
 
 		 368 aa  630  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  76.52 
 
 		 367 aa  577  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  42.26 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  42.6 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  38.67 
 
 		 379 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  40.71 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  39.94 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.89 
 
 		 330 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.91 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  32.25 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.1 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  32.72 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  35.11 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  30.58 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  30.7 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  36.58 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  31 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  40.41 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  33.08 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.52 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  33.59 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.74 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  28.51 
 
 		 360 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  31.39 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  30.94 
 
 		 351 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.6 
 
 		 521 aa  89.7  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  29.71 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  27.73 
 
 		 328 aa  87.4  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  30.04 
 
 		 351 aa  85.9  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  24.48 
 
 		 505 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  32.46 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  26.62 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  26.62 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  27.4 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.4 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.99 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  30.2 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  25.91 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  22.79 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  27.35 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  26.92 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  27.72 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  25.23 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.05 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.43 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  28.64 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  25.9 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  25.9 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  26.37 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  26.37 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  26.15 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  27.33 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  26.09 
 
 		 367 aa  52.8  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.76 
 
 		 398 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  27 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  22.53 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  25.35 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.97 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  20.87 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  23.58 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  20.87 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  25.39 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  26 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2214  AAA ATPase, central region  43.75 
 
 		 534 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.17049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0687  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 459 aa  43.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>