More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2936 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 361 aa  672    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.45 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  47.43 
 
 		 414 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.84 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.33 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.86 
 
 		 418 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.89 
 
 		 367 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  41.21 
 
 		 368 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  41.59 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  41.59 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.78 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  35.75 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  36.61 
 
 		 365 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  38.74 
 
 		 327 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  37.37 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.11 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  32.51 
 
 		 348 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  32.01 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  28.62 
 
 		 331 aa  119  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  30.74 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  31.94 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  31.74 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.99 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  35.09 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  29.35 
 
 		 332 aa  106  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.44 
 
 		 354 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.25 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  34.01 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  33.69 
 
 		 372 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  32.06 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  33.55 
 
 		 341 aa  89.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  33.89 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  27.59 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  29.37 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  28.67 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  29.83 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  31.69 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  30.92 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  30.56 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  27.86 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  26.26 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  30.9 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  31.61 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  30.9 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  24.81 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  25.9 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  20.38 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  24.57 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  21.79 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  30.83 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  28.17 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  29.9 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  27.72 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  36.36 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.17 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  23.21 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  29.2 
 
 		 505 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0383  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  35.08 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.26 
 
 		 521 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  34.65 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1284  psp operon transcriptional activator  35.95 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3045  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  37.67 
 
 		 637 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  26.43 
 
 		 489 aa  53.1  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3227  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 362 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  36.94 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  24.83 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  26.42 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  32.86 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.11 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  31.39 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2336  phage shock protein operon transcriptional activator  34.22 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.816239  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  32.92 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  27.44 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2498  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.13 
 
 		 445 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1763  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.15 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6636  putative sigma54 specific transcriptional regulator  40 
 
 		 375 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2611  phage shock protein operon transcriptional activator  35.71 
 
 		 328 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1753  phage shock protein operon transcriptional activator  36.18 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5791  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.19 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6156  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164312  normal  0.688082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  30.37 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2771  proprionate catabolism activator, Fis family  31.79 
 
 		 659 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0968139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0381  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  32.12 
 
 		 663 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.24565  normal  0.15807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4754  Fis family proprionate catabolism activator  33.54 
 
 		 662 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.574647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3286  Fis family proprionate catabolism activator  33.54 
 
 		 660 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749536  normal  0.0314954 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0140  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.54 
 
 		 660 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.738564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  35.56 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0842  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.41 
 
 		 697 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.801762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  36.3 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003815  Psp operon transcriptional activator  34.72 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0230  Fis family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3766  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.25 
 
 		 481 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.8 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5343  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.54 
 
 		 662 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0693  sigma-54 dependent transcriptional regulator  29.41 
 
 		 643 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5518  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.54 
 
 		 662 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  32.54 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0670  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.39 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>