83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2964 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  711    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  65.71 
 
 
347 aa  491  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  63.11 
 
 
348 aa  471  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  41.59 
 
 
331 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  42.69 
 
 
327 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  40.8 
 
 
327 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.14 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.25 
 
 
347 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.95 
 
 
364 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  42.37 
 
 
379 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  40.13 
 
 
340 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  36.89 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  35.84 
 
 
332 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.75 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  32.52 
 
 
367 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  33.03 
 
 
368 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  31.31 
 
 
334 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  31 
 
 
369 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  33 
 
 
369 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  33.09 
 
 
369 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  32.45 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.68 
 
 
354 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  31.53 
 
 
342 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  31.09 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  31.11 
 
 
372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  33.07 
 
 
372 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  33.07 
 
 
379 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  33.33 
 
 
372 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  29.57 
 
 
354 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  29.57 
 
 
354 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  34.04 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  39.06 
 
 
364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.04 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.07 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  32.31 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  32.31 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  28.38 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.03 
 
 
414 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.56 
 
 
367 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  35.71 
 
 
369 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  30.74 
 
 
362 aa  107  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  29.05 
 
 
328 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  29.87 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.86 
 
 
361 aa  99.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  31.54 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  31.54 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  30.28 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.85 
 
 
398 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  32.48 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  29.81 
 
 
412 aa  85.9  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  23.81 
 
 
505 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.62 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.39 
 
 
521 aa  80.9  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  25.81 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  32.83 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  28.44 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  27.13 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  25.95 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  27.64 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  26.38 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  25.98 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  25.59 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  28.65 
 
 
396 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  25.98 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  25.74 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  24.51 
 
 
353 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  22.04 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  25.21 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  24.15 
 
 
383 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.08 
 
 
403 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  33.61 
 
 
620 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  28.92 
 
 
715 aa  45.1  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  26.43 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.88 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  27.14 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.67 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.06 
 
 
271 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  32.08 
 
 
279 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  24.76 
 
 
307 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  29.93 
 
 
781 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  27.03 
 
 
789 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.45 
 
 
332 aa  42.7  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  28.21 
 
 
302 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>