More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3152 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  100 
 
 		 620 aa  1178    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.33 
 
 		 324 aa  299  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.4 
 
 		 310 aa  280  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.27 
 
 		 297 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2355  von Willebrand factor type A  39.66 
 
 		 329 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000782033  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0878  von Willebrand factor type A  38.58 
 
 		 318 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  32.28 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  38 
 
 		 327 aa  99.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  24.53 
 
 		 326 aa  97.4  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  32.56 
 
 		 347 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  34.55 
 
 		 329 aa  95.9  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  30.69 
 
 		 302 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  30.56 
 
 		 337 aa  94.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  35.23 
 
 		 345 aa  94.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0240  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.69 
 
 		 303 aa  94  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.288695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  35.23 
 
 		 315 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  29.64 
 
 		 344 aa  92  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  33.66 
 
 		 356 aa  92  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.72 
 
 		 344 aa  92  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  34.87 
 
 		 319 aa  92  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  30.77 
 
 		 349 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  28.09 
 
 		 324 aa  91.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  30.2 
 
 		 318 aa  91.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  33.33 
 
 		 317 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.63 
 
 		 332 aa  91.3  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.45 
 
 		 309 aa  91.3  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  32.91 
 
 		 264 aa  90.9  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  29.84 
 
 		 346 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.8 
 
 		 310 aa  90.5  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  31.2 
 
 		 333 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  30.88 
 
 		 337 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  29.71 
 
 		 302 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2146  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.85 
 
 		 327 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  34.24 
 
 		 306 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  30.63 
 
 		 339 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  30.8 
 
 		 310 aa  89  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.02 
 
 		 313 aa  88.6  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  33.51 
 
 		 308 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  36.67 
 
 		 345 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08430  MoxR-like ATPase  35.48 
 
 		 332 aa  88.2  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  33.51 
 
 		 317 aa  87.8  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  35.45 
 
 		 318 aa  87.8  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  28.85 
 
 		 335 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  33.51 
 
 		 317 aa  87.8  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  32.82 
 
 		 320 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.15 
 
 		 354 aa  87.4  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.84 
 
 		 306 aa  87.4  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  35.84 
 
 		 306 aa  87.4  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30 
 
 		 325 aa  87.4  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.32 
 
 		 308 aa  87  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.03 
 
 		 322 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.59 
 
 		 327 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.26 
 
 		 350 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  35.68 
 
 		 396 aa  86.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  30 
 
 		 309 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.25 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.29 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  25.98 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  34.43 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  31.06 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  33.2 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  28.85 
 
 		 335 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  37.97 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  31.06 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0902  ATPase  30.5 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  29.47 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  31.06 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  29.38 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0845  ATPase  32.52 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.418031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.65 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  33.68 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  31.38 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.86 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  30.45 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.72 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  25.16 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  33.69 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.43 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  31.54 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  33.7 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  27.2 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1589  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.74 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0629676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.33 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  35.26 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.38 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  31.63 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  33.33 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.4 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  33.88 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  33.88 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  33.33 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  33.88 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  33.88 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.65 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  31.18 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0818  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.96 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.761606  normal  0.617267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1787  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.94 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000466383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.74 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  28.02 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.59 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>