10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0878 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0878  von Willebrand factor type A  100 
 
 
318 aa  609  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2355  von Willebrand factor type A  54.57 
 
 
329 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000782033  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  38.58 
 
 
620 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4950  von Willebrand factor type A  38.78 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  30.28 
 
 
317 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  38.46 
 
 
543 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  28.85 
 
 
523 aa  49.3  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  34.53 
 
 
546 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  37.5 
 
 
547 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  34.55 
 
 
903 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>