25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2355 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2355  von Willebrand factor type A  100 
 
 
329 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000782033  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0878  von Willebrand factor type A  54.92 
 
 
318 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  40.37 
 
 
620 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4950  von Willebrand factor type A  35.64 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  31.29 
 
 
523 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  30 
 
 
317 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  37.29 
 
 
543 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  35.59 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  33.81 
 
 
546 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
480 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  23.91 
 
 
571 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  37.29 
 
 
637 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  26.5 
 
 
143 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0521  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 
382 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 
423 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.03 
 
 
619 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  29.14 
 
 
792 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  32.46 
 
 
420 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.09 
 
 
621 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  34.85 
 
 
620 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  32.02 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  35.77 
 
 
674 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  33.33 
 
 
618 aa  42.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  32.34 
 
 
696 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 
562 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>