More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03742 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03742  chelatase protein  100 
 
 
637 aa  1251    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  49.31 
 
 
614 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.86 
 
 
688 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.57 
 
 
616 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.59 
 
 
674 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  42.38 
 
 
669 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  48.29 
 
 
674 aa  462  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  41.49 
 
 
680 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  43.13 
 
 
696 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.65 
 
 
673 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  44.56 
 
 
660 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  48.72 
 
 
657 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  45.85 
 
 
719 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  44.19 
 
 
699 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  45.56 
 
 
705 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  45.93 
 
 
713 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.9 
 
 
622 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.9 
 
 
622 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.9 
 
 
622 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  46.05 
 
 
618 aa  425  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  44.85 
 
 
638 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  44.86 
 
 
670 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  44.53 
 
 
626 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.18 
 
 
653 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.45 
 
 
665 aa  398  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  37.72 
 
 
653 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.94 
 
 
674 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  37.44 
 
 
650 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  56.16 
 
 
788 aa  359  9e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  55.93 
 
 
372 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  54.05 
 
 
364 aa  349  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.91 
 
 
671 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  54.17 
 
 
346 aa  340  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  54.12 
 
 
776 aa  340  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.78 
 
 
337 aa  335  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  49.4 
 
 
364 aa  333  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.09 
 
 
337 aa  333  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.09 
 
 
337 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  46.39 
 
 
356 aa  333  8e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.09 
 
 
337 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.34 
 
 
370 aa  332  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.34 
 
 
362 aa  331  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.52 
 
 
362 aa  331  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.64 
 
 
677 aa  329  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.06 
 
 
374 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.58 
 
 
362 aa  327  3e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  51.09 
 
 
362 aa  324  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  34.46 
 
 
683 aa  323  4e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  48.97 
 
 
337 aa  323  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  50.78 
 
 
362 aa  322  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.68 
 
 
340 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.57 
 
 
600 aa  320  3.9999999999999996e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.88 
 
 
358 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.88 
 
 
358 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  51.51 
 
 
351 aa  320  5e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  50.77 
 
 
365 aa  319  9e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.81 
 
 
364 aa  319  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  55.52 
 
 
738 aa  319  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.95 
 
 
664 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.62 
 
 
373 aa  318  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.56 
 
 
357 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  51.4 
 
 
362 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.02 
 
 
362 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  51.4 
 
 
362 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.94 
 
 
369 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.68 
 
 
340 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.25 
 
 
405 aa  317  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  51.55 
 
 
334 aa  317  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  51.4 
 
 
362 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.42 
 
 
341 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.55 
 
 
368 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  48.59 
 
 
637 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  48.59 
 
 
637 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.83 
 
 
363 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  52.6 
 
 
680 aa  313  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  57.27 
 
 
730 aa  313  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  47.76 
 
 
346 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  51.6 
 
 
689 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  51.07 
 
 
345 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.29 
 
 
336 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.07 
 
 
340 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.18 
 
 
379 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.98 
 
 
348 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.45 
 
 
340 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.74 
 
 
377 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  48.84 
 
 
347 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.55 
 
 
394 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.38 
 
 
382 aa  303  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.6 
 
 
725 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.99 
 
 
711 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  50.93 
 
 
334 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  52.47 
 
 
749 aa  300  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.89 
 
 
391 aa  300  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.35 
 
 
383 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  32.8 
 
 
727 aa  299  1e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  50.62 
 
 
334 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  50.62 
 
 
334 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.61 
 
 
341 aa  295  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  53.52 
 
 
629 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.75 
 
 
386 aa  295  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>