37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4950 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4950  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 248 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  38.81 
 
 		 620 aa  82.4  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2355  von Willebrand factor type A  36.44 
 
 		 329 aa  78.6  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000782033  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0878  von Willebrand factor type A  39.45 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 427 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  24.62 
 
 		 412 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  30.54 
 
 		 393 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 421 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  32.34 
 
 		 717 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  31.2 
 
 		 418 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0459  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  28.57 
 
 		 669 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  34.91 
 
 		 903 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  24.42 
 
 		 426 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 462 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  31.79 
 
 		 459 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 		 744 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0933  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 661 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.147469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.28 
 
 		 671 aa  45.4  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3765  von Willebrand factor type A  31.75 
 
 		 749 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262699 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  23.26 
 
 		 523 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 		 936 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 		 412 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  31.78 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.4 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.4 
 
 		 674 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  34.23 
 
 		 610 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  35 
 
 		 629 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 		 480 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 		 1446 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  27.59 
 
 		 352 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.54 
 
 		 412 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  27.59 
 
 		 352 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.9 
 
 		 416 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  34.81 
 
 		 592 aa  42  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>